30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0377 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  77.96 
 
 		 438 aa  634    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  100 
 
 		 430 aa  845    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  73.83 
 
 		 436 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  57.24 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  56.18 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  56.53 
 
 		 427 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  56.77 
 
 		 427 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  56.37 
 
 		 439 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  53.19 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4783  putative MFS superfamily transport protein  59.08 
 
 		 453 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127813  normal  0.486857 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4002  major facilitator transporter  56.47 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1331  major facilitator superfamily MFS_1  49.07 
 
 		 439 aa  342  1e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865021  normal  0.03557 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  47.87 
 
 		 448 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  41.86 
 
 		 457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  39.91 
 
 		 445 aa  292  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  41.72 
 
 		 458 aa  290  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  42.45 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 449 aa  286  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  43.65 
 
 		 450 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  40.52 
 
 		 442 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  35.14 
 
 		 441 aa  207  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01661  hypothetical protein  32.36 
 
 		 385 aa  155  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450943  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  28.89 
 
 		 939 aa  87.4  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3730  ATP/ADP translocase-like protein  28.12 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.374188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1797  major facilitator transporter  57.63 
 
 		 73 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000398276  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  23.33 
 
 		 529 aa  51.2  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54110  nucleotide transporter 5  30.82 
 
 		 547 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.779323  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1256  ATP/ADP translocase-like  22.19 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45145  nucleotide transporter 2  25.17 
 
 		 575 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0739731  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50189  nucleotide transporter 3  22.97 
 
 		 666 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>