14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3065 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3065  hypothetical protein  100 
 
 
563 aa  1164    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177227  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4180  hypothetical protein  34.8 
 
 
339 aa  169  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1700  hypothetical protein  28.66 
 
 
342 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.330384 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00840  hypothetical protein  29.95 
 
 
423 aa  62  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0241  hypothetical protein  34.53 
 
 
299 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138041 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1199  glycosyltransferase  31.01 
 
 
289 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2519  putative glycosyltransferase  27.4 
 
 
292 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3013  hypothetical protein  30.6 
 
 
267 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1480  hypothetical protein  30.77 
 
 
281 aa  47.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5388  hypothetical protein  33.33 
 
 
300 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.293041  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1198  hypothetical protein  27.13 
 
 
295 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4747  hypothetical protein  31.9 
 
 
343 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4523  hypothetical protein  30.28 
 
 
260 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3735  hypothetical protein  34.48 
 
 
338 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324611  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>