15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1935 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1935  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  764    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5664  hypothetical protein  45.58 
 
 		 382 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1930  hypothetical protein  38.64 
 
 		 595 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  0.0291599 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3567  hypothetical protein  30.34 
 
 		 575 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.336155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3939  hypothetical protein  32.37 
 
 		 649 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462657  normal  0.150476 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3564  hypothetical protein  30.49 
 
 		 572 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4789  hypothetical protein  30.25 
 
 		 587 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0838792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2373  hypothetical protein  30.29 
 
 		 619 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.651768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5660  hypothetical protein  25.84 
 
 		 588 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0874  ICE-like protease  23.38 
 
 		 360 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00749471  normal  0.127131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.6 
 
 		 735 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0979  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  19.76 
 
 		 704 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0877  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.81 
 
 		 708 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111073  normal  0.182276 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0982  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20 
 
 		 704 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2831  hypothetical protein  26.32 
 
 		 605 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>