36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1766 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1766  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  546  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1744  hypothetical protein  95.67 
 
 
277 aa  531  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3141  hypothetical protein  90.91 
 
 
275 aa  499  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1751  hypothetical protein  89.05 
 
 
283 aa  500  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000562915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1741  hypothetical protein  96.15 
 
 
52 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101791 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1758  hypothetical protein  92.31 
 
 
52 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367221  hitchhiker  0.00526717 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0368  hypothetical protein  32.02 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.730391  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1757  hypothetical protein  74.6 
 
 
63 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  79.55 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1128  hypothetical protein  26.39 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2072  hypothetical protein  25.71 
 
 
306 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.166176 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2074  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.236799 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1544  hypothetical protein  32.43 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3233  hypothetical protein  28.91 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  29.25 
 
 
313 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  31.4 
 
 
317 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2559  hypothetical protein  32.07 
 
 
276 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.789765  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3554  hypothetical protein  32.07 
 
 
276 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  26.89 
 
 
296 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1904  hypothetical protein  46 
 
 
138 aa  49.3  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1070  hypothetical protein  58.97 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3814  hypothetical protein  25.45 
 
 
261 aa  45.4  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.04819  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  26.05 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1516  hypothetical protein  29.87 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.469218  normal  0.704146 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  26.05 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1515  hypothetical protein  26.37 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  26.05 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  26.05 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1542  hypothetical protein  26.37 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.966764  normal  0.0160527 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  26.05 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4928  hypothetical protein  29.06 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2097  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.607253  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3060  hypothetical protein  25 
 
 
280 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1128  hypothetical protein  22.49 
 
 
268 aa  42.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0225553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0262  hypothetical protein  25.23 
 
 
275 aa  42  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.359016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1818  hypothetical protein  28.07 
 
 
280 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.937622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>