51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1744 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1744  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1766  hypothetical protein  95.67 
 
 
269 aa  531  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3141  hypothetical protein  93.82 
 
 
275 aa  517  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1751  hypothetical protein  91.87 
 
 
283 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000562915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1741  hypothetical protein  94.23 
 
 
52 aa  105  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101791 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1758  hypothetical protein  90.38 
 
 
52 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367221  hitchhiker  0.00526717 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1757  hypothetical protein  77.61 
 
 
63 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535154 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0368  hypothetical protein  27.47 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.730391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2074  hypothetical protein  23.99 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.236799 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1128  hypothetical protein  25.43 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2072  hypothetical protein  24.66 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.166176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  75 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1544  hypothetical protein  31.93 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3233  hypothetical protein  28.57 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1070  hypothetical protein  43.24 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3554  hypothetical protein  32.8 
 
 
276 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2559  hypothetical protein  32.8 
 
 
276 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.789765  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5118  hypothetical protein  27.36 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  21.83 
 
 
309 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  21.83 
 
 
309 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4928  hypothetical protein  28.19 
 
 
315 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  23.97 
 
 
300 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  26.44 
 
 
292 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2097  hypothetical protein  46.94 
 
 
87 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.607253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  25.31 
 
 
296 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1515  hypothetical protein  27.33 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3814  hypothetical protein  26.36 
 
 
261 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.04819  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1542  hypothetical protein  27.33 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.966764  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  23.7 
 
 
298 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1516  hypothetical protein  31.17 
 
 
251 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.469218  normal  0.704146 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  27.7 
 
 
313 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  23.7 
 
 
298 aa  46.2  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  25.5 
 
 
319 aa  46.2  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  26.53 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  24.1 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  24.1 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  24.1 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  48 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3043  hypothetical protein  23.1 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0033024  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  24.48 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  25.32 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  26.2 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  24.48 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  25.32 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1904  hypothetical protein  39.66 
 
 
138 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  25.32 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  25 
 
 
300 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  50 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1128  hypothetical protein  23.18 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0225553  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3810  hypothetical protein  27.19 
 
 
274 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00863066  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  25.75 
 
 
297 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>