138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4137 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4137  ADP-ribosylation/crystallin J1  100 
 
 
332 aa  660    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782037  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2921  ADP-ribosylglycohydrolase  72.56 
 
 
337 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18040  ADP-ribosylglycohydrolase  57.93 
 
 
342 aa  322  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992393  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2285  ADP-ribosylation/Crystallin J1  47.4 
 
 
333 aa  255  8e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0289  ADP-ribosylglycohydrolase  43.7 
 
 
347 aa  253  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15150  ADP-ribosylglycohydrolase  54.85 
 
 
355 aa  250  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275445  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3606  ADP-ribosylation/Crystallin J1  34.83 
 
 
358 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1139  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  31.91 
 
 
334 aa  160  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.130877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2218  ADP-ribosylglycohydrolase, putative  32.73 
 
 
328 aa  158  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0784925  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02027  predicted hydrolase  31.91 
 
 
334 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01991  hypothetical protein  31.91 
 
 
334 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3078  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  31.61 
 
 
334 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0571365 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2387  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  31.61 
 
 
334 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1548  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.61 
 
 
334 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.64096  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1558  ADP-ribosylation/Crystallin J1  31.61 
 
 
334 aa  156  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329085  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2235  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  31.61 
 
 
334 aa  156  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0965  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  31.61 
 
 
334 aa  155  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3310  ADP-ribosylation/Crystallin J1  31 
 
 
333 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1468  ADP-ribosylglycohydrolase  28.87 
 
 
332 aa  149  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0157  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.03 
 
 
361 aa  144  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1000  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.09 
 
 
333 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.945503  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2487  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  31.91 
 
 
334 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2330  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  31.61 
 
 
334 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2375  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  31.61 
 
 
334 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592392  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2286  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  31.61 
 
 
334 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2379  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  31.61 
 
 
334 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.376098  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0488  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.86 
 
 
319 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1495  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.69 
 
 
302 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.944205  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0983  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.28 
 
 
302 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0441  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.33 
 
 
344 aa  99.8  7e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1645  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.31 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.932283  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0269  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.74 
 
 
302 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16086  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0950  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.19 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2428  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.08 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0067  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.71 
 
 
295 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0024  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.09 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2793  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.93 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4398  ADP-ribosylglycohydrolase superfamily  24.78 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4284  ADP-ribosylglycohydrolase superfamily  24.78 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4313  ADP-ribosylglycohydrolase superfamily  24.78 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4465  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  24.78 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1447  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.89 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2513  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.1 
 
 
371 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.836174  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4396  ADP-ribosylglycohydrolase superfamily  24.48 
 
 
346 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1208  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.76 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0350047  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2761  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.17 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79492  normal  0.771767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2136  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  32.95 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000382928 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1562  ADP-ribosylglycohydrolase-like  27.59 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000180951  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1210  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  24.14 
 
 
317 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0331208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0057  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.42 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0325  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.48 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00576959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04620  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.21 
 
 
329 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04650  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.06 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5543  ADP-ribosylation/Crystallin J1  32.23 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2082  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  31.25 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1008  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.89 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.861843  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2093  ADP-ribosylglycohydrolase  24.85 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3202  hypothetical protein  27.54 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0680  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.07 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.782258  normal  0.702569 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0150  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.41 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3018  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  24.7 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0338  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.08 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2800  dinitrogenase reductase activating glycohydrolase  24.17 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622873  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4977  ADP-ribosylglycohydrolase  26.17 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0363  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.45 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69675  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0373  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.45 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0746  ADP-ribosylation/crystallin J1  21.12 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4607  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.69 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916055  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4641  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.2 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5762  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.37 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000610186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.39 
 
 
508 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0420  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.47 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156753  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4210  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.38 
 
 
331 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1731  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.66 
 
 
308 aa  63.9  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1073  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.23 
 
 
355 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4684  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.08 
 
 
314 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6191  ADP-ribosylglycohydrolase  32.52 
 
 
322 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.567308  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3462  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  24.23 
 
 
301 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0352  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.53 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0244712  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0397  ADP-ribosylglycohydrolase  24.85 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0076  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.04 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1877  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.78 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.251448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3565  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  22.49 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2658  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.34 
 
 
296 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2369  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.97 
 
 
327 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0120569  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3043  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  29.95 
 
 
298 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.72 
 
 
490 aa  59.7  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0877  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  24.76 
 
 
295 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.41 
 
 
505 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4406  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.13 
 
 
463 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0255559  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5053  ADP-ribosylation/crystallin J1  22.96 
 
 
313 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.962607  normal  0.612081 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2408  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.1 
 
 
297 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.194034  normal  0.0934858 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1446  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.95 
 
 
329 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00190171  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_4610  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.14 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.383385  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1670  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.93 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.820356  normal  0.114795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6466  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.61 
 
 
368 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011832  Mpal_2490  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.15 
 
 
311 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.360174  normal  0.126045 
 
 
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NC_007492  Pfl01_3893  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.32 
 
 
306 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008148  Rxyl_1119  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.73 
 
 
307 aa  56.6  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_0265  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.93 
 
 
539 aa  56.2  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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