94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1780 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1780  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  244  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1774  S23 ribosomal protein  53.91 
 
 		 118 aa  120  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113241  normal  0.0178351 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1776  S23 ribosomal protein  48.33 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353039  normal  0.0187612 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0925  S23 ribosomal protein  48.31 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3825  hypothetical protein  47.79 
 
 		 118 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.169171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2891  hypothetical protein  47.79 
 
 		 121 aa  110  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0159035 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0667  S23 ribosomal protein  46.61 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2569  S23 ribosomal protein  48.21 
 
 		 115 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3829  S23 ribosomal protein  47.41 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0815906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3816  hypothetical protein  44.54 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0743  S23 ribosomal protein  49.47 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0653  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0033  hypothetical protein  42.24 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4365  S23 ribosomal  39.5 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.981218  normal  0.704063 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1903  S23 ribosomal protein  41.88 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.452499  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4754  S23 ribosomal protein  39.32 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.32042  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4923  S23 ribosomal protein  39.67 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2958  hypothetical protein  42.86 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2018  S23 ribosomal protein  42.61 
 
 		 116 aa  88.2  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.575414  normal  0.264087 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03005  hypothetical protein  48.78 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0510  S23 ribosomal protein  39.13 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3674  S23 ribosomal protein  37.61 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3082  hypothetical protein  41.44 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4875  S23 ribosomal protein  38.14 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2670  hypothetical protein  46.79 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0809  S23 ribosomal protein  39.13 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0716  hypothetical protein  45.24 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1843  S23 ribosomal protein  41.3 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.561977  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2263  hypothetical protein  40.54 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  decreased coverage  0.000429969 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0769  hypothetical protein  45.24 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1396  hypothetical protein  43.64 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2403  hypothetical protein  38.89 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.589367  hitchhiker  0.00347564 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0596  S23 ribosomal protein  33.63 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0419728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0702  hypothetical protein  42.39 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1383  hypothetical protein  35.04 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2842  hypothetical protein  36.04 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.578199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1181  S23 ribosomal protein  32.17 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1864  S23 ribosomal protein  36.36 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.508556  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1770  hypothetical protein  37.29 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00388506  normal  0.0836423 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2639  S23 ribosomal protein  37.86 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3192  hypothetical protein  36.94 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1908  S23 ribosomal protein  33.9 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2542  hypothetical protein  36.04 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1316  hypothetical protein  36.04 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0254819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1133  S23 ribosomal protein  33.63 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2144  hypothetical protein  42.2 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3034  S23 ribosomal protein  38.71 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0984  S23 ribosomal  44.3 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.302642  normal  0.219777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0008  hypothetical protein  36.21 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0176  hypothetical protein  36.21 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.713236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1260  hypothetical protein  36.21 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1266  hypothetical protein  36.21 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2021  hypothetical protein  36.21 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.933908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2528  hypothetical protein  36.21 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2947  hypothetical protein  36.21 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0834  S23 ribosomal protein  36.29 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.530691  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1768  S23 ribosomal protein  32.23 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.392074  normal  0.0791201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1652  hypothetical protein  36.19 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2787  hypothetical protein  34.82 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000122053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0610  S23 ribosomal protein  30.36 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28865e-18 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1960  S23 ribosomal protein  32.77 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0405  hypothetical protein  35.34 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.743042  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1949  S23 ribosomal protein  31.93 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.512605 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1940  S23 ribosomal protein  31.93 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0249687  normal  0.793802 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2609  S23 ribosomal protein  33.06 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.839204  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0797  hypothetical protein  34.45 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171877 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1973  S23 ribosomal protein  31.93 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174055 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2230  hypothetical protein  32.14 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.8637e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1160  S23 ribosomal protein  32.76 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2821  hypothetical protein  41.56 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1904  S23 ribosomal protein  31.4 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3035  S23 ribosomal  45 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.964559  hitchhiker  0.00587494 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0266  hypothetical protein  30.17 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0352  hypothetical protein  32.71 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50367  normal  0.137183 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1495  S23 ribosomal protein  32.79 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4127  hypothetical protein  34.78 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1809  hypothetical protein  32.29 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1773  hypothetical protein  32.29 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0046265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0042  hypothetical protein  32.29 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0903  hypothetical protein  32.29 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118462  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4428  glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.09 
 
 		 583 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0039  S23 ribosomal  35.96 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.746441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2487  S23 ribosomal protein  34.52 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0863  S23 ribosomal protein  36.9 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2269  S23 ribosomal protein  31.65 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3212  S23 ribosomal protein  28.21 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.69732  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3995  hypothetical protein  43.48 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0782  S23 ribosomal protein  29.2 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.653003 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1554  S23 ribosomal protein  27.36 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3761  S23 ribosomal protein  25.86 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1793  hypothetical protein  24.56 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3459  S23 ribosomal protein  43.84 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2996  hypothetical protein  30.99 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1934  S23 ribosomal protein  35.37 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285916  normal  0.790704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>