76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3459 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3459  S23 ribosomal protein  100 
 
 		 127 aa  263  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0352  hypothetical protein  46.58 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50367  normal  0.137183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0596  S23 ribosomal protein  43.9 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0419728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3212  S23 ribosomal protein  38.89 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.69732  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1903  S23 ribosomal protein  40.7 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.452499  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3829  S23 ribosomal protein  39.77 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0815906  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2269  S23 ribosomal protein  39.51 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1495  S23 ribosomal protein  37.5 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4754  S23 ribosomal protein  42.68 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.32042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0610  S23 ribosomal protein  40.24 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28865e-18 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0769  hypothetical protein  40.24 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0716  hypothetical protein  40.24 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1904  S23 ribosomal protein  35.63 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1160  S23 ribosomal protein  36.14 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1396  hypothetical protein  42.86 
 
 		 119 aa  50.8  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4365  S23 ribosomal  38.37 
 
 		 127 aa  50.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.981218  normal  0.704063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1133  S23 ribosomal protein  40.24 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0743  S23 ribosomal protein  35.16 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1908  S23 ribosomal protein  35.71 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472505 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1973  S23 ribosomal protein  35.63 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174055 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2230  hypothetical protein  39.02 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.8637e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2670  hypothetical protein  43.24 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1768  S23 ribosomal protein  37.21 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.392074  normal  0.0791201 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2891  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0159035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2263  hypothetical protein  45.21 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  decreased coverage  0.000429969 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0653  hypothetical protein  34.21 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3816  hypothetical protein  40.28 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0809  S23 ribosomal protein  31.67 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1960  S23 ribosomal protein  34.44 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1949  S23 ribosomal protein  34.44 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.512605 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1940  S23 ribosomal protein  34.44 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0249687  normal  0.793802 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0925  S23 ribosomal protein  36.9 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2947  hypothetical protein  40.26 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0008  hypothetical protein  40.26 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0176  hypothetical protein  40.26 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.713236  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2958  hypothetical protein  38.36 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1260  hypothetical protein  40.26 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1266  hypothetical protein  40.26 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1843  S23 ribosomal protein  36.05 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.561977  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2528  hypothetical protein  40.26 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2021  hypothetical protein  40.26 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.933908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1793  hypothetical protein  35.62 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4875  S23 ribosomal protein  34.94 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2787  hypothetical protein  32.94 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000122053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0834  S23 ribosomal protein  35.8 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.530691  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0405  hypothetical protein  38.96 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.743042  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1864  S23 ribosomal protein  35.37 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.508556  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1776  S23 ribosomal protein  36.59 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353039  normal  0.0187612 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2609  S23 ribosomal protein  32.95 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.839204  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0984  S23 ribosomal  41.89 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.302642  normal  0.219777 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0039  S23 ribosomal  34.71 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.746441 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0266  hypothetical protein  32 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0797  hypothetical protein  30.95 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171877 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0702  hypothetical protein  35.62 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0033  hypothetical protein  34.52 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2996  hypothetical protein  36.99 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1774  S23 ribosomal protein  36.59 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113241  normal  0.0178351 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2144  hypothetical protein  33.75 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0667  S23 ribosomal protein  36.25 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3995  hypothetical protein  35.9 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4428  glutamine--scyllo-inositol transaminase  43.86 
 
 		 583 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2018  S23 ribosomal protein  37.97 
 
 		 116 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.575414  normal  0.264087 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3034  S23 ribosomal protein  29.41 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2569  S23 ribosomal protein  36.11 
 
 		 115 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3825  hypothetical protein  33.75 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.169171  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3082  hypothetical protein  33.77 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1780  hypothetical protein  43.84 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1652  hypothetical protein  32.53 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1809  hypothetical protein  33.77 
 
 		 122 aa  40.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1773  hypothetical protein  33.77 
 
 		 122 aa  40.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0046265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0903  hypothetical protein  33.77 
 
 		 122 aa  40.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0042  hypothetical protein  33.77 
 
 		 122 aa  40.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2403  hypothetical protein  41.67 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.589367  hitchhiker  0.00347564 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0510  S23 ribosomal protein  38.98 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426974  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1770  hypothetical protein  32.05 
 
 		 119 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00388506  normal  0.0836423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1181  S23 ribosomal protein  30.77 
 
 		 122 aa  40  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>