22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0077 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0077  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  280  4e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000439598  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2728  hypothetical protein  46.72 
 
 
144 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  9.50807e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0663  protein gp16  37.5 
 
 
192 aa  82  3e-15  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.62215e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0774  protein gp16  37.5 
 
 
192 aa  82  3e-15  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.15084e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0425  protein of unknown function DUF1018  39.86 
 
 
145 aa  78.2  3e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4132  hypothetical protein  41.79 
 
 
154 aa  77.8  5e-14  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.48477e-06 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2921  hypothetical protein  40.3 
 
 
154 aa  76.6  1e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2667  hypothetical protein  30.66 
 
 
177 aa  65.1  3e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2284  putative phage regluatory protein  34.97 
 
 
158 aa  63.9  7e-10  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3025  hypothetical protein  35.61 
 
 
215 aa  58.2  3e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3060  hypothetical protein  35.38 
 
 
217 aa  55.5  3e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3375  protein of unknown function DUF1018  32.28 
 
 
233 aa  52.4  2e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0720  protein of unknown function DUF1018  32.28 
 
 
146 aa  50.1  1e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.915248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1653  bacteriophage protein  33.87 
 
 
189 aa  49.7  1e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0658  Mu-like prophage protein GP16  32.28 
 
 
202 aa  50.1  1e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4512  hypothetical protein  32.14 
 
 
225 aa  48.5  3e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216446  normal  0.847002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0651  hypothetical protein  27.15 
 
 
201 aa  48.1  4e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2076  hypothetical protein  26.67 
 
 
206 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000389889  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2114  hypothetical protein  33.08 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.848091  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1286  hypothetical protein  33.08 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1561  hypothetical protein  29.01 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2123  hypothetical protein  25.16 
 
 
211 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  1.1259e-06  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>