22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0077 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0077  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  280  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000439598  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2728  hypothetical protein  46.72 
 
 		 144 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000950807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0663  protein gp16  37.5 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000162215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0774  protein gp16  37.5 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000715084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0425  protein of unknown function DUF1018  39.86 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4132  hypothetical protein  41.79 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2921  hypothetical protein  40.3 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2667  hypothetical protein  30.66 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2284  putative phage regluatory protein  34.97 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3025  hypothetical protein  35.61 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3060  hypothetical protein  35.38 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3375  protein of unknown function DUF1018  32.28 
 
 		 233 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0658  Mu-like prophage protein GP16  32.28 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0720  protein of unknown function DUF1018  32.28 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.915248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1653  bacteriophage protein  33.87 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4512  hypothetical protein  32.14 
 
 		 225 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216446  normal  0.847002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0651  hypothetical protein  27.15 
 
 		 201 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2076  hypothetical protein  26.67 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000389889  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2114  hypothetical protein  33.08 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.848091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1286  hypothetical protein  33.08 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1561  hypothetical protein  29.01 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2123  hypothetical protein  25.16 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000011259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>