More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0029 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0029  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  100 
 
 
425 aa  853  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0625  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.87 
 
 
424 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.58 
 
 
426 aa  334  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.82 
 
 
426 aa  332  8e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0639  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.15 
 
 
424 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7833e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3196  methyl-accepting chemotaxis protein  45.11 
 
 
428 aa  327  2e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3335  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.82 
 
 
430 aa  316  5e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4474  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.7 
 
 
439 aa  201  2e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4455  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.46 
 
 
462 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.46 
 
 
462 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.080509  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  34.4 
 
 
660 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.91 
 
 
564 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  34.13 
 
 
660 aa  191  3e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.05 
 
 
660 aa  186  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 
660 aa  184  2e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  3.51139e-13 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  32.8 
 
 
650 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  30.13 
 
 
658 aa  183  5e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  33.07 
 
 
650 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  33.07 
 
 
650 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  29.87 
 
 
658 aa  183  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  31.51 
 
 
660 aa  182  9e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  29.53 
 
 
658 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  29.53 
 
 
658 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  29.53 
 
 
658 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  29.95 
 
 
658 aa  180  5e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 
565 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  29.02 
 
 
658 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
462 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.185231  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  31.23 
 
 
658 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  30.66 
 
 
658 aa  175  1e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.44 
 
 
676 aa  174  2e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 
571 aa  174  2e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4362  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.5 
 
 
445 aa  174  3e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.138074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.32 
 
 
660 aa  174  4e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.95 
 
 
658 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  31.81 
 
 
660 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  31.55 
 
 
660 aa  169  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.05 
 
 
660 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  31.55 
 
 
660 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.31062e-07 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  31.55 
 
 
660 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  31.55 
 
 
660 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  31.55 
 
 
660 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  31.55 
 
 
660 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.22 
 
 
417 aa  166  1e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.15 
 
 
693 aa  163  5e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.47 
 
 
520 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000607785  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4841  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.99 
 
 
666 aa  163  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.83 
 
 
662 aa  162  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0088  methyl-accepting chemotaxis protein  32.29 
 
 
666 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5156  methyl-accepting chemotaxis protein  32.55 
 
 
666 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2122  methyl-accepting chemotaxis protein  31.55 
 
 
660 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.44 
 
 
452 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00060467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  31.3 
 
 
660 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4749  chemotaxis signal transducer  29.82 
 
 
564 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5149  chemotaxis signal transducer  29.82 
 
 
564 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000249122 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4768  methyl-accepting chemotaxis protein  29.82 
 
 
564 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0065  methyl-accepting chemotaxis protein  29.55 
 
 
564 aa  160  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00962116  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.22 
 
 
571 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5180  methyl-accepting chemotaxis protein  29.55 
 
 
564 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  9.13296e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5185  methyl-accepting chemotaxis protein  29.29 
 
 
564 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00149704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5194  chemotaxis signal transducer  29.55 
 
 
564 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.25 
 
 
661 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1639  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.01 
 
 
566 aa  156  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00481169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.12 
 
 
588 aa  155  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.031352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.41 
 
 
666 aa  155  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1248  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.24 
 
 
417 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5162  methyl-accepting chemotaxis protein  32.03 
 
 
666 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.32 
 
 
654 aa  153  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.06955e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0740  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.32 
 
 
596 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000672019  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.97 
 
 
639 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 
660 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1328  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.85 
 
 
658 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 
660 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 
660 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5151  methyl-accepting chemotaxis protein  31.2 
 
 
666 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 
660 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3774  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.55 
 
 
574 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  28.79 
 
 
660 aa  149  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.51 
 
 
573 aa  149  1e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0116952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  29.74 
 
 
660 aa  148  2e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  28.53 
 
 
660 aa  148  2e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5280  methyl-accepting chemotaxis protein  28.5 
 
 
563 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4905  methyl-accepting chemotaxis protein  28.5 
 
 
563 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.52 
 
 
566 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22670  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.08 
 
 
737 aa  147  4e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.55 
 
 
588 aa  147  4e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.857462  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4724  methyl-accepting chemotaxis protein  31.06 
 
 
666 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.18 
 
 
732 aa  147  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.36436e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4739  methyl-accepting chemotaxis protein  31.14 
 
 
666 aa  146  7e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.28 
 
 
650 aa  146  8e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0989  methyl-accepting chemotaxis protein  28.2 
 
 
689 aa  146  8e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4882  methyl-accepting chemotaxis protein  31.06 
 
 
666 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.09 
 
 
572 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0355909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5256  methyl-accepting chemotaxis protein  31.06 
 
 
666 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5124  methyl-accepting chemotaxis protein  31.06 
 
 
669 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.59 
 
 
658 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4864  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.02 
 
 
564 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.81 
 
 
663 aa  143  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.113755  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.99 
 
 
566 aa  143  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.61 
 
 
689 aa  142  1e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>