48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0060 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0060  abortive infection protein  100 
 
 		 192 aa  374  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1134  abortive infection protein  48.7 
 
 		 197 aa  177  8e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000223923 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0086  abortive infection protein  48.96 
 
 		 193 aa  174  6e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49455  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0154  abortive infection protein  36.45 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0142  abortive infection protein  42.86 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0827934 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0124  abortive infection protein  35.05 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  42.57 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1192  abortive infection protein  34.09 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  40.23 
 
 		 267 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  42.11 
 
 		 279 aa  51.2  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1450  abortive infection protein  35.42 
 
 		 336 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101728  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  32.97 
 
 		 273 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  30.85 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  31.63 
 
 		 273 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  31.43 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3281  abortive infection protein  33.33 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.93013  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  34.75 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  31.19 
 
 		 337 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  35.34 
 
 		 278 aa  45.1  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  44.05 
 
 		 420 aa  45.1  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  44.44 
 
 		 288 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2196  Abortive infection protein  35.34 
 
 		 325 aa  44.7  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.260267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  29.36 
 
 		 313 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  30.28 
 
 		 337 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  36.78 
 
 		 235 aa  44.7  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  44.44 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  30.28 
 
 		 337 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  29.36 
 
 		 313 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  28.28 
 
 		 237 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  28.28 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  28.97 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  30.28 
 
 		 337 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 337 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 337 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0005  Abortive infection protein  33.73 
 
 		 281 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0159968 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  41.3 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  42.22 
 
 		 237 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1898  abortive infection protein  37.35 
 
 		 154 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.728406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 337 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  31.58 
 
 		 319 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  36.25 
 
 		 246 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  29.31 
 
 		 272 aa  42.4  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  58.82 
 
 		 281 aa  42.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  38.55 
 
 		 448 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1486  abortive infection family protein  30.12 
 
 		 246 aa  42  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000034413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  29.36 
 
 		 337 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  38.33 
 
 		 256 aa  42  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  38.55 
 
 		 448 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>