37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3913 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3913  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  466  1e-130  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  3.17623e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1597  hypothetical protein  64.66 
 
 
233 aa  319  2e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.321672  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2576  hypothetical protein  65.95 
 
 
234 aa  317  8e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000189024  normal  0.179906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2414  hypothetical protein  65.52 
 
 
234 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00806149  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2484  hypothetical protein  65.52 
 
 
234 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00768413  normal  0.204356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1713  hypothetical protein  63.36 
 
 
246 aa  314  6e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409323  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2666  hypothetical protein  62.93 
 
 
246 aa  313  2e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0398844  normal  0.0175894 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1691  hypothetical protein  62.93 
 
 
246 aa  313  2e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666754  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1676  hypothetical protein  62.93 
 
 
246 aa  313  2e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0089383  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2794  hypothetical protein  65.09 
 
 
234 aa  311  4e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0241  hypothetical protein  65.22 
 
 
241 aa  311  7e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1227  hypothetical protein  64.63 
 
 
234 aa  310  9e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.04269e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1565  hypothetical protein  63.79 
 
 
234 aa  310  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001025  hypothetical protein  62.98 
 
 
235 aa  306  1e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07109  hypothetical protein  62.98 
 
 
235 aa  306  2e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2037  hypothetical protein  61.8 
 
 
232 aa  305  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.81321e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1601  hypothetical protein  61.37 
 
 
235 aa  305  5e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00766974  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1505  hypothetical protein  60.81 
 
 
234 aa  294  7e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250222  normal  0.876319 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0530  hypothetical protein  58.37 
 
 
234 aa  294  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4969  hypothetical protein  61.93 
 
 
236 aa  286  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.349038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1835  hypothetical protein  61.47 
 
 
246 aa  285  3e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2753  hypothetical protein  59.53 
 
 
234 aa  281  8e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15175  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1445  hypothetical protein  59.46 
 
 
240 aa  272  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2105  hypothetical protein  56.84 
 
 
234 aa  272  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.796531 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1017  hypothetical protein  48.28 
 
 
236 aa  209  3e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1501  hypothetical protein  50.68 
 
 
236 aa  197  1e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0760  hypothetical protein  27.68 
 
 
381 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  2.76584e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05560  hypothetical protein  27.01 
 
 
201 aa  45.8  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.15855e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0819  hypothetical protein  27.68 
 
 
381 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  6.48113e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0767  hypothetical protein  27.12 
 
 
381 aa  45.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.07523e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0954  hypothetical protein  27.68 
 
 
378 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0862  hypothetical protein  27.68 
 
 
372 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  1.16192e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0823  hypothetical protein  32.29 
 
 
364 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2065  hypothetical protein  24.88 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0952  hypothetical protein  27.75 
 
 
381 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  2.15951e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1042  hypothetical protein  26.55 
 
 
378 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.15662e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0694  hypothetical protein  25.14 
 
 
378 aa  42  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.134736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>