More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2425 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0859  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.57 
 
 		 794 aa  822    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2551  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.11 
 
 		 784 aa  764    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.985058 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4279  xanthine dehydrogenase, XdhB subunit  56.31 
 
 		 799 aa  860    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1034  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  51.59 
 
 		 799 aa  746    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0974442  normal  0.558383 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2096  xanthine dehydrogenase subunit B  50.46 
 
 		 792 aa  755    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4865  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  61.99 
 
 		 796 aa  937    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0350  xanthine dehydrogenase, putative  52.03 
 
 		 780 aa  738    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3661  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  55.4 
 
 		 792 aa  838    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1154  xanthine dehydrogenase  50.85 
 
 		 812 aa  743    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547676  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2041  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  51.26 
 
 		 787 aa  712    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1814  xanthine dehydrogenase  55.91 
 
 		 839 aa  842    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1904  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  51.26 
 
 		 787 aa  712    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2426  xanthine oxidase  51.17 
 
 		 793 aa  783    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2706  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  51.26 
 
 		 787 aa  712    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.970809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3159  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.39 
 
 		 787 aa  714    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1589  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  56.31 
 
 		 799 aa  858    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.589614  normal  0.979072 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3213  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  51.39 
 
 		 787 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1796  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  56.34 
 
 		 797 aa  857    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3198  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.39 
 
 		 787 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3555  xanthine oxidase  45.43 
 
 		 825 aa  672    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3461  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.91 
 
 		 787 aa  765    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222432 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3925  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  50.32 
 
 		 784 aa  775    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2862  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.92 
 
 		 779 aa  735    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303628  normal  0.42301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0794  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.39 
 
 		 788 aa  771    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0872  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  51.26 
 
 		 787 aa  712    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.208444  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0729  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.33 
 
 		 787 aa  764    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1409  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  51.66 
 
 		 787 aa  721    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.836704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3103  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  50.71 
 
 		 801 aa  764    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2301  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  55.03 
 
 		 797 aa  858    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.794851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3605  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.78 
 
 		 799 aa  843    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.82083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4621  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  54.11 
 
 		 777 aa  799    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3135  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.79 
 
 		 779 aa  734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.787826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1338  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  49.55 
 
 		 814 aa  692    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.01144  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0805  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.04 
 
 		 787 aa  780    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1480  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  50.39 
 
 		 801 aa  718    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0949  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  51.38 
 
 		 802 aa  761    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.420397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3885  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  50 
 
 		 788 aa  771    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1789  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  47 
 
 		 767 aa  679    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.65016  normal  0.238087 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2959  xanthine dehydrogenase molybdenum-binding subunit  50.45 
 
 		 781 aa  750    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0461211 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0225  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.38 
 
 		 793 aa  708    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467704  normal  0.0688088 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3810  xanthine dehydrogenase  57.37 
 
 		 799 aa  870    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1788  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  59.23 
 
 		 797 aa  892    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5001  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  51.58 
 
 		 828 aa  757    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1141  xanthine dehydrogenase  57.63 
 
 		 856 aa  885    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.864044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0452  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  53.27 
 
 		 784 aa  752    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0892  xanthine oxidase  50.59 
 
 		 783 aa  758    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0579725  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0498  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  47.16 
 
 		 782 aa  702    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2705  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  51.17 
 
 		 777 aa  771    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.233827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0349  xanthine dehydrogenase  50.91 
 
 		 787 aa  780    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3843  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  56.31 
 
 		 799 aa  857    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303444  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3719  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.41 
 
 		 779 aa  769    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3042  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.97 
 
 		 800 aa  764    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.0190661 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2425  xanthine dehydrogenase  100 
 
 		 784 aa  1634    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0712  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.5 
 
 		 818 aa  733    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3238  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  45.43 
 
 		 825 aa  673    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2834  xanthine oxidase  52.37 
 
 		 781 aa  793    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.266912  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2449  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.03 
 
 		 801 aa  770    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0712  xanthine dehydrogenase  51.33 
 
 		 787 aa  764    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2752  xanthine oxidase  55.85 
 
 		 798 aa  867    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.988781  normal  0.624971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44740  xanthine dehydrogenase  57.5 
 
 		 799 aa  873    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0454132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0798  xanthine oxidase  49.87 
 
 		 830 aa  726    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0833  hypothetical protein  51.04 
 
 		 787 aa  782    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551522  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2247  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  49.93 
 
 		 788 aa  769    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22280  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  56.97 
 
 		 797 aa  850    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.775322  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3321  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  50.72 
 
 		 781 aa  739    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.98232  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2421  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.31 
 
 		 785 aa  792    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4258  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  49.6 
 
 		 770 aa  733    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.933602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2698  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  56.38 
 
 		 779 aa  873    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3906  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  49.49 
 
 		 816 aa  731    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1923  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.2 
 
 		 788 aa  772    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02516  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  68.29 
 
 		 788 aa  1042    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.973765  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5909  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.78 
 
 		 808 aa  760    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3760  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  49.93 
 
 		 764 aa  704    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4498  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  51.49 
 
 		 785 aa  785    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.736766  normal  0.0805913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1129  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  52.81 
 
 		 823 aa  764    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.818016  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2604  xanthine dehydrogenase  44.62 
 
 		 800 aa  634  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1454  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  44.52 
 
 		 772 aa  628  1e-178  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0936  xanthine oxidase  43.87 
 
 		 812 aa  605  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0258  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  43.37 
 
 		 804 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1637  xanthine oxidase  43.17 
 
 		 767 aa  580  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  38.64 
 
 		 1363 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6766  Xanthine dehydrogenase  37.48 
 
 		 769 aa  513  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09178  conserved hypothetical protein  38.3 
 
 		 1350 aa  496  1e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  37.8 
 
 		 1387 aa  478  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3947  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  55.35 
 
 		 825 aa  422  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0952887 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1730  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  30.19 
 
 		 754 aa  324  3e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.142729  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1732  xanthine dehydrogenase  29.73 
 
 		 730 aa  297  5e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4003  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.32 
 
 		 772 aa  256  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.567509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0432  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  27.2 
 
 		 753 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1642  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  28.34 
 
 		 782 aa  231  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1960  xanthine dehydrogenase subunit XdhA  28.5 
 
 		 763 aa  227  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.308037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5971  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  27.19 
 
 		 715 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.848912 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3594  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  27.84 
 
 		 774 aa  224  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0775  xanthine dehydrogenase, molybdenum-binding subunit, putative  27.89 
 
 		 752 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0918  Xanthine dehydrogenase  27.89 
 
 		 752 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.803279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1135  hypothetical protein  25.59 
 
 		 713 aa  218  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3076  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  27.59 
 
 		 757 aa  217  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.346881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0826  Xanthine dehydrogenase  26.34 
 
 		 765 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3191  xanthine dehydrogenase subunit XdhA  26.34 
 
 		 765 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3026  xanthine dehydrogenase subunit XdhA  26.34 
 
 		 765 aa  215  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.214024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>