56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2136 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2136  hypothetical protein  100 
 
 		 863 aa  1744    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.233841  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2064  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1086 aa  110  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1849  hypothetical protein  34.48 
 
 		 1104 aa  105  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2110  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1222 aa  105  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2187  hypothetical protein  34.86 
 
 		 1108 aa  105  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87239  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2186  hypothetical protein  36 
 
 		 1066 aa  105  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.222967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1791  hypothetical protein  36 
 
 		 1070 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.684722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1845  hypothetical protein  36 
 
 		 1068 aa  103  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.725746  normal  0.580829 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4714  hypothetical protein  31.71 
 
 		 882 aa  98.2  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2434  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1148 aa  98.2  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.491363  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1924  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1164 aa  97.8  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787497  normal  0.0260112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2427  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1154 aa  97.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0924938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2545  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1120 aa  97.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.960719  normal  0.0399031 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2166  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1307 aa  96.3  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2698  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1205 aa  95.1  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1481  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1100 aa  88.2  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1914  hypothetical protein  31.61 
 
 		 1134 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167412  normal  0.675287 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1636  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1058 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0361894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1770  hypothetical protein  31.07 
 
 		 879 aa  82.4  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.930224 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2264  conserved hypothetical protein  31.07 
 
 		 879 aa  82.4  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0095574  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2003  hypothetical protein  31.4 
 
 		 879 aa  80.9  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1619  hypothetical protein  30.51 
 
 		 879 aa  80.1  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01366  hypothetical protein  30.51 
 
 		 879 aa  80.1  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1566  hypothetical protein  30.51 
 
 		 879 aa  80.1  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01353  hypothetical protein  30.51 
 
 		 879 aa  80.1  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1468  hypothetical protein  30.51 
 
 		 879 aa  80.1  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2274  hypothetical protein  29.94 
 
 		 879 aa  78.6  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0618  hypothetical protein  26.83 
 
 		 673 aa  75.5  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3336  hypothetical protein  26.06 
 
 		 860 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1763  hypothetical protein  29.67 
 
 		 878 aa  74.7  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0322713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1826  hypothetical protein  29.67 
 
 		 878 aa  74.7  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1766  hypothetical protein  29.67 
 
 		 878 aa  74.7  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.916643  normal  0.0307934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1510  hypothetical protein  29.67 
 
 		 878 aa  74.7  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1693  hypothetical protein  29.67 
 
 		 878 aa  74.7  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1943  hypothetical protein  29.95 
 
 		 879 aa  74.3  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00013464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35270  hypothetical protein  25.52 
 
 		 863 aa  71.6  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786077  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2591  hypothetical protein  29.95 
 
 		 863 aa  70.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1045  hypothetical protein  25.71 
 
 		 857 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0251387  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2291  hypothetical protein  29.44 
 
 		 863 aa  69.7  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0813621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2599  hypothetical protein  29.94 
 
 		 870 aa  68.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1919  hypothetical protein  31.13 
 
 		 904 aa  67.8  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1917  hypothetical protein  25.64 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2169  hypothetical protein  27.66 
 
 		 700 aa  67.4  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2213  hypothetical protein  31.13 
 
 		 898 aa  66.6  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.139058 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1809  hypothetical protein  31.13 
 
 		 910 aa  66.6  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.903538  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70070  hypothetical protein  25.99 
 
 		 854 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6081  hypothetical protein  26.09 
 
 		 847 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.82344  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1472  hypothetical protein  26.09 
 
 		 712 aa  65.1  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1372  hypothetical protein  27.92 
 
 		 707 aa  62  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.709287  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1084  hypothetical protein  28.67 
 
 		 888 aa  61.2  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1629  hypothetical protein  25.46 
 
 		 633 aa  61.2  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1205  hypothetical protein  24.57 
 
 		 702 aa  60.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1553  hypothetical protein  25.5 
 
 		 891 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0122844  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1780  hypothetical protein  22.52 
 
 		 867 aa  46.6  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0209  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1131 aa  45.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4479  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1057 aa  45.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>