16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0424 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0424  PilT domain-containing protein  100 
 
 
145 aa  292  9e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.437549  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0230  PilT domain-containing protein  45.07 
 
 
145 aa  108  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.874187 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1694  PilT domain-containing protein  42.34 
 
 
147 aa  105  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000132965  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1187  PilT domain-containing protein  40.41 
 
 
149 aa  94.4  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1290  hypothetical protein  43.01 
 
 
197 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.734735 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1709  PilT domain-containing protein  31.25 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.567805  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1911  PilT protein-like  26.32 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0407  hypothetical protein  28.67 
 
 
165 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337339  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  33.87 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0088  hypothetical protein  29.66 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.713807  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0086  hypothetical protein  29.66 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0195  PilT protein-like  25.34 
 
 
146 aa  43.5  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0169  PilT domain-containing protein  23.08 
 
 
132 aa  42.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1902  hypothetical protein  27.27 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00660694  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0867  PilT protein domain protein  25.4 
 
 
133 aa  41.6  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4992  hypothetical protein  24.49 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>