35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0053 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0053  30S ribosomal protein S17e  100 
 
 		 71 aa  141  3e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1095  30S ribosomal protein S17e  85.92 
 
 		 71 aa  127  6e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0019  30S ribosomal protein S17e  87.32 
 
 		 71 aa  127  6e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0050  30S ribosomal protein S17e  83.61 
 
 		 71 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0479934 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0460  ribosomal protein S17E-like protein  56.67 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.160081 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0349  ribosomal protein S17e  53.03 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1459  30S ribosomal protein S17e  62.9 
 
 		 62 aa  77.8  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1598  30S ribosomal protein S17e  52.38 
 
 		 63 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1030  30S ribosomal protein S17e  52.38 
 
 		 63 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.413697  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0316  30S ribosomal protein S17e  50.79 
 
 		 63 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1491  30S ribosomal protein S17e  58.62 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0827  ribosomal protein S17E-like  50.82 
 
 		 86 aa  70.1  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.942401  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1450  30S ribosomal protein S17e  49.21 
 
 		 63 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0909  30S ribosomal protein S17e  50 
 
 		 63 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.938862  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1246  Ribosomal protein S17e  43.28 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0477  30S ribosomal protein S17e  51.61 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.510307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2338  30S ribosomal protein S17e  55.77 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0792439  normal  0.108991 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1889  Ribosomal protein S17E-like protein  52.83 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1226  SSU ribosomal protein S17E  53.57 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.711601 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0034  Ribosomal protein S17e  52.83 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2585  30S ribosomal protein S17e  52.83 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.140579  normal  0.47256 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0324  30S ribosomal protein S17e  53.23 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.382941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0146  30S ribosomal protein S17e  44.07 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3917  Ribosomal protein S17E-like protein  50 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05979  40S ribosomal protein S17, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10300)  50 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1395  30S ribosomal protein S17e  43.55 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.407431  normal  0.322807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1149  30S ribosomal protein S17e  46.03 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0766  30S ribosomal protein S17e  50.94 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00222665  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31424  Ribosomal protein S17, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  45 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00015015  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02960  conserved hypothetical protein  45 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.354727  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76215  40S ribosomal protein S17.e.B  46.67 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.480741 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2260  30S ribosomal protein S17e  41.07 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.252248 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19314  predicted protein  43.33 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1262  Ribosomal protein S17e  36.92 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1430  hypothetical protein  41.94 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>