15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1960 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1960  bacteriochlorophyll C binding protein  100 
 
 		 81 aa  161  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0265  chlorosome envelope protein A  92.59 
 
 		 80 aa  148  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000105111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0219  chlorosome envelope protein A  92.59 
 
 		 80 aa  148  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.540959  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2572  bacteriochlorophyll C binding protein  91.36 
 
 		 80 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000646673  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2145  bacteriochlorophyll C binding protein  96.3 
 
 		 80 aa  133  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0310736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2299  bacteriochlorophyll C binding protein  91.36 
 
 		 81 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000633498  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2195  bacteriochlorophyll C binding protein  90.12 
 
 		 81 aa  122  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574411 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0231  bacteriochlorophyll C binding protein  51.32 
 
 		 83 aa  77.4  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2359  bacteriochlorophyll C binding protein  50 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.25226  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0939  chlorosome envelope protein E  51.28 
 
 		 85 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.414323 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0260  bacteriochlorophyll C binding protein  45.45 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2013  chlorosome envelope protein E  48.72 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.41812 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0250  chlorosome envelope protein E  50.63 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0207  bacteriochlorophyll C binding protein  42.86 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2542  bacteriochlorophyll C binding protein  44.87 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>