23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_36915 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_36915  predicted protein  100 
 
 
381 aa  795    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40884  predicted protein  32.92 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00671341  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2525  hypothetical protein  20.8 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0720  hypothetical protein  24.25 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000252618  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1728  protein of unknown function DUF155  24.64 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00082913  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5021  hypothetical protein  22.97 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.268747 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3007  protein of unknown function DUF155  20 
 
 
274 aa  63.2  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129271 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2060  hypothetical protein  20.67 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1331  hypothetical protein  19.83 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0640  hypothetical protein  23.08 
 
 
256 aa  60.8  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0224  hypothetical protein  21.14 
 
 
269 aa  60.1  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0703  hypothetical protein  21.55 
 
 
271 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197614  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0139  hypothetical protein  21.66 
 
 
254 aa  57  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0312  hypothetical protein  21.66 
 
 
254 aa  57  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000226241 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1174  hypothetical protein  22.41 
 
 
274 aa  53.5  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0594  hypothetical protein  22.8 
 
 
278 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1501  hypothetical protein  22.78 
 
 
276 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10806  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12110)  20.69 
 
 
515 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3149  hypothetical protein  20.68 
 
 
271 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02410  cytoplasm protein, putative  22.63 
 
 
636 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58312  predicted protein  23.35 
 
 
254 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0881  hypothetical protein  21.76 
 
 
274 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849765  hitchhiker  0.00000209176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2558  hypothetical protein  22.02 
 
 
271 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>