23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50365 on replicon NC_011697
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011697  PHATRDRAFT_50365  predicted protein  100 
 
 
707 aa  1476    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899784  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15016  predicted protein  35.58 
 
 
119 aa  77.4  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34891  predicted protein  35.19 
 
 
180 aa  76.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36337  predicted protein  34.51 
 
 
900 aa  70.5  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_6839  predicted protein  36.08 
 
 
101 aa  68.2  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32183  predicted protein  33.59 
 
 
246 aa  65.1  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549576  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_7959  predicted protein  33.67 
 
 
98 aa  63.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8749  predicted protein  28.71 
 
 
109 aa  63.5  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67483  predicted protein  30.39 
 
 
657 aa  62.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_6817  predicted protein  31.82 
 
 
106 aa  62.4  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280813  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15516  predicted protein  35.71 
 
 
103 aa  62  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0761412  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9540  predicted protein  35.64 
 
 
97 aa  60.1  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177599  normal  0.685809 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40769  predicted protein  32.35 
 
 
102 aa  60.1  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0145425  normal  0.460561 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00279  FlbDPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00658]  30.21 
 
 
314 aa  57.8  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.266348  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_9404  predicted protein  31.91 
 
 
96 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0386241  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41981  predicted protein  34.38 
 
 
99 aa  52.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315481  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07174  putative Myb-like transcription factor (Eurofung)  29.46 
 
 
305 aa  51.2  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0643653  normal  0.181525 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08377  putative Myb-like transcription factor (Eurofung)  27.27 
 
 
288 aa  50.8  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.247587  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63672  predicted protein  29.41 
 
 
712 aa  49.7  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10944  Pre-mRNA-splicing factor cef1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW35]  35.9 
 
 
791 aa  49.3  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_47583  predicted protein  24.47 
 
 
328 aa  47.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14143  predicted protein  30 
 
 
102 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06446  putative Myb-like transcription factor (Eurofung)  28.28 
 
 
248 aa  44.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>