11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16798 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_16798  predicted protein  100 
 
 
157 aa  321  3e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17683  predicted protein  29.71 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32248  predicted protein  29.45 
 
 
215 aa  63.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.672355  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48591  predicted protein  29.9 
 
 
276 aa  55.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684444  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45601  predicted protein  27.59 
 
 
274 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41744  predicted protein  29.55 
 
 
219 aa  47.8  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00440664  normal  0.343781 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_51073  predicted protein  25.98 
 
 
200 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00798092  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29604  predicted protein  25.18 
 
 
227 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03510  v-SNARE, putative  33.33 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02090  vesicle-associated membrane protein 712, putative  24.58 
 
 
306 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54066  predicted protein  24.5 
 
 
227 aa  42.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>