22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13192 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_13192  predicted protein  100 
 
 
74 aa  149  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31513  predicted protein  76.71 
 
 
756 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01590  conserved hypothetical protein  72.6 
 
 
838 aa  120  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.196806  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10944  Pre-mRNA-splicing factor cef1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW35]  74.29 
 
 
791 aa  110  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35246  predicted protein  68.92 
 
 
668 aa  108  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0592899  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_6839  predicted protein  37.5 
 
 
101 aa  53.5  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8749  predicted protein  37.5 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41981  predicted protein  41.27 
 
 
99 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315481  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9540  predicted protein  35.94 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177599  normal  0.685809 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15016  predicted protein  34.72 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34891  predicted protein  34.38 
 
 
180 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07174  putative Myb-like transcription factor (Eurofung)  34.33 
 
 
305 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0643653  normal  0.181525 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43387  predicted protein  37.5 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_47583  predicted protein  37.5 
 
 
328 aa  47.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63672  predicted protein  42.25 
 
 
712 aa  47  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40769  predicted protein  37.93 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0145425  normal  0.460561 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15516  predicted protein  36.36 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0761412  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08377  putative Myb-like transcription factor (Eurofung)  33.87 
 
 
288 aa  45.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.247587  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36337  predicted protein  36.67 
 
 
900 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14143  predicted protein  35.82 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_6817  predicted protein  34.92 
 
 
106 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280813  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67483  predicted protein  27.87 
 
 
657 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>