33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13158 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_13158  predicted protein  100 
 
 
114 aa  236  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64167  predicted protein  47.9 
 
 
198 aa  108  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.285306  normal  0.876007 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10249  mitochondrial peptidyl-tRNA hydrolase Pth2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10430)  47.41 
 
 
205 aa  102  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167558  normal  0.131659 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01630  aminoacyl-tRNA hydrolase, putative  39.47 
 
 
204 aa  93.2  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1481  peptidyl-tRNA hydrolase  39.64 
 
 
116 aa  89.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0997  peptidyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 
116 aa  87  8e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.872117  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0207  peptidyl-tRNA hydrolase  38.98 
 
 
117 aa  86.7  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.223033  normal  0.0587052 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0283  peptidyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 
116 aa  86.3  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1631  peptidyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 
116 aa  86.3  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.61994  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3204  peptidyl-tRNA hydrolase  37.72 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.989283  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1472  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.84 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1153  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.29 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0684  peptidyl-tRNA hydrolase  35.96 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.577357  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2410  Aminoacyl-tRNA hydrolase  34.21 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0804  peptidyl-tRNA hydrolase  35.09 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.425499  hitchhiker  0.000240374 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0466  peptidyl-tRNA hydrolase  36.84 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0826773 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44311  predicted protein  36.28 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.701325  normal  0.717756 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1277  peptidyl-tRNA hydrolase  35.09 
 
 
115 aa  77  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1251  peptidyl-tRNA hydrolase  33.33 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0865  peptidyl-tRNA hydrolase  36.04 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0020  peptidyl-tRNA hydrolase  35.4 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1200  peptidyl-tRNA hydrolase  38.6 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1400  peptidyl-tRNA hydrolase  35.96 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0905  peptidyl-tRNA hydrolase  35.09 
 
 
120 aa  72  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000145084 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0573  peptidyl-tRNA hydrolase  33.63 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0140623  normal  0.519073 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1284  Aminoacyl-tRNA hydrolase  32.74 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2097  peptidyl-tRNA hydrolase  37.72 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2662  peptidyl-tRNA hydrolase  31.86 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0809  peptidyl-tRNA hydrolase  31.58 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0451427  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2354  peptidyl-tRNA hydrolase  31.58 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.848355 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  32.17 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.614979  normal  0.635641 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2123  peptidyl-tRNA hydrolase  33.91 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1991  peptidyl-tRNA hydrolase  33.04 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>