12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13053 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_13053  predicted protein  100 
 
 		 725 aa  1493    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.34373  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42299  predicted protein  34.97 
 
 		 873 aa  456  1e-127  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00111  Pre-mRNA-splicing factor syf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH69]  33.08 
 
 		 851 aa  386  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01310  spliceosome complex protein, putative  37.14 
 
 		 1031 aa  352  1e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51927  predicted protein  27.87 
 
 		 854 aa  163  8.000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176454  normal  0.69842 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01259  Pre-mRNA-splicing factor clf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDX1]  20.56 
 
 		 673 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.588968  normal  0.14932 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06730  RNA splicing-related protein, putative  22.31 
 
 		 726 aa  53.5  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525366  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36244  predicted protein  22.63 
 
 		 696 aa  50.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20135  predicted protein  20.21 
 
 		 690 aa  48.9  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  20.11 
 
 		 1486 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53682  predicted protein  19.59 
 
 		 714 aa  45.4  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.38 
 
 		 565 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>