16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0066 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0066  cell wall hydrolase/autolysin  100 
 
 
450 aa  929  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3687  cell wall hydrolase/autolysin  45.83 
 
 
450 aa  385  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3791  cell wall hydrolase/autolysin  45.37 
 
 
450 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0488  putative lipoprotein  43.4 
 
 
201 aa  128  2e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.241796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1228  cell wall hydrolase/autolysin  36.67 
 
 
438 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  4.50762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0538  hypothetical protein  42.86 
 
 
204 aa  101  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00554774  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  34.34 
 
 
1805 aa  97.4  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1790  copper amine oxidase-like  27.53 
 
 
428 aa  82.8  1e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0382  copper amine oxidase-like protein  30.39 
 
 
403 aa  79.3  1e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0436  copper amine oxidase domain-containing protein  27.2 
 
 
471 aa  78.2  3e-13  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1644  copper amine oxidase domain-containing protein  31.61 
 
 
446 aa  70.5  5e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  34.4 
 
 
890 aa  68.9  2e-10  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  8.52469e-05  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  28.66 
 
 
452 aa  64.7  3e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0039  hypothetical protein  30.07 
 
 
201 aa  62  2e-08  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0040  hypothetical protein  30.07 
 
 
203 aa  61.6  2e-08  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2689  hypothetical protein  29.01 
 
 
212 aa  46.6  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>