33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0385 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0385  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like protein  100 
 
 		 46 aa  97.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0381  phosphotransferase KptA/Tpt1  92.68 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0438  phosphotransferase KptA/Tpt1  66.67 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00660  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  67.5 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0054  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  65 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3665  Phosphate acetyltransferase  72.73 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000562336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04163  hypothetical protein  72.73 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000225053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04200  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  72.73 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000393415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  72.73 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4559  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  72.73 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4774  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  72.73 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4875  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  69.7 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4788  RNA 2'-phosphotransferase  47.83 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0729  phosphotransferase KptA/Tpt1  59.46 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6764  phosphate acetyltransferase  55 
 
 		 211 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534993  normal  0.870017 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1928  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  65.62 
 
 		 184 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0075  phosphotransferase KptA/Tpt1  48.78 
 
 		 180 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2137  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  65.62 
 
 		 184 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0213319  normal  0.0608547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1806  phosphate acetyltransferase  67.74 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.825619  normal  0.0231057 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2545  RNA 2'-phosphotransferase  65.62 
 
 		 195 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2451  phosphotransferase KptA/Tpt1  57.58 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  hitchhiker  0.000000261836 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0748  phosphate acetyltransferase  65.62 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.325809  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1795  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  62.5 
 
 		 194 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3135  phosphotransferase KptA/Tpt1  57.58 
 
 		 180 aa  47  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04510  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  45 
 
 		 180 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350174  hitchhiker  0.00000275449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0177  phosphotransferase KptA/Tpt1  58.06 
 
 		 177 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342477  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2868  phosphate acetyltransferase  51.52 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.784433 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0018  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  50 
 
 		 209 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.840157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0145  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  50 
 
 		 186 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.71719  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4889  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  47.37 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5513  putative RNA 2'-phosphotransferase  64.29 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0209017  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0143  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  50 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.264895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4048  phosphotransferase KptA/Tpt1  44.74 
 
 		 182 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.624394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>