41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_04671 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_04671  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  232  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04981  hypothetical protein  95.73 
 
 		 117 aa  225  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.746916  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0442  transcriptional regulator AbrB  94.87 
 
 		 117 aa  224  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288973  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05051  hypothetical protein  78.63 
 
 		 117 aa  189  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0340173  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1774  transcriptional regulator AbrB  75.86 
 
 		 118 aa  183  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102447  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04971  hypothetical protein  75.86 
 
 		 118 aa  183  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04401  hypothetical protein  71.55 
 
 		 120 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06391  hypothetical protein  68.97 
 
 		 120 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0770948 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1757  transcriptional regulator AbrB  59.5 
 
 		 138 aa  139  9e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0605  transcriptional regulator AbrB  63.48 
 
 		 123 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.295719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1805  hypothetical protein  45.38 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.730454  normal  0.343994 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1463  hypothetical protein  43.33 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0708  hypothetical protein  43.7 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1859  transcriptional regulator AbrB  43.93 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1413  hypothetical protein  42.5 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.48166 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18171  hypothetical protein  42.5 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0411  transciptional regulator  42.02 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0897  hypothetical protein  42.15 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11061  hypothetical protein  42.02 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0216  AbrB family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.932065  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06381  hypothetical protein  40.5 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0573  transcriptional regulator AbrB  42.02 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.432889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1444  transcriptional regulator  42.99 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06291  transciptional regulator  41.18 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1969  transcriptional regulator AbrB  40.83 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05991  transcriptional regulator AbrB  42.02 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05761  hypothetical protein  41.67 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0493  hypothetical protein  42.5 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.514631  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4400  hypothetical protein  46.73 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000505081  normal  0.726686 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1525  hypothetical protein  40.83 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.140017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2255  hypothetical protein  40.19 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0192999  normal  0.0349457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3125  transcriptional regulator AbrB  44.04 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5329  transcriptional regulator, AbrB family  40.19 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0396  transcriptional regulator, AbrB family  41.12 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0524  AbrB family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0405  transcriptional regulator, AbrB family  41.12 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.270466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3802  transcriptional regulator  39.25 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3854  hypothetical protein  39.25 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2180  hypothetical protein  42.2 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0991  transcriptional regulator AbrB  41.67 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0061  transcriptional regulator AbrB  40.34 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>