21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1067 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1067  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  524  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3809  hypothetical protein  42.96 
 
 
259 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3952  hypothetical protein  42.59 
 
 
259 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0663928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3866  hypothetical protein  44.35 
 
 
245 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0382  hypothetical protein  34.2 
 
 
217 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3568  hypothetical protein  37.87 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.896385  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2069  hypothetical protein  38.71 
 
 
235 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0306  hypothetical protein  47.71 
 
 
285 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0266  hypothetical protein  44.95 
 
 
253 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.702144  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5847  hypothetical protein  32.21 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1923  hypothetical protein  36.84 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0109339  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2084  hypothetical protein  32.89 
 
 
281 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00272631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4740  hypothetical protein  34.69 
 
 
282 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0296125  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4079  hypothetical protein  32.69 
 
 
304 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7717  hypothetical protein  32.89 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3673  hypothetical protein  30.26 
 
 
258 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2746  hypothetical protein  34.07 
 
 
279 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4425  putative cytoplasmic protein  33.78 
 
 
208 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4095  hypothetical protein  32.5 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7283  hypothetical protein  29.2 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.316954  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0810  putative cytoplasmic protein  46.15 
 
 
41 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0316479  decreased coverage  4.17209e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>