12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0030 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0030  hypothetical protein  100 
 
 		 875 aa  1781    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0193988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2143  hypothetical protein  48.32 
 
 		 871 aa  785    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  29.47 
 
 		 1255 aa  311  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2915  hypothetical protein  34.21 
 
 		 866 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2725  hypothetical protein  34.8 
 
 		 866 aa  105  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0192734  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2585  hypothetical protein  34.47 
 
 		 866 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3130  hypothetical protein  34.31 
 
 		 868 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1722  hypothetical protein  29.32 
 
 		 774 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1746  hypothetical protein  29.32 
 
 		 774 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.333719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4360  hypothetical protein  29.29 
 
 		 719 aa  72.8  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0384  hypothetical protein  29.57 
 
 		 730 aa  60.1  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.228891  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1826  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  30.28 
 
 		 206 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.362999  normal  0.34813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>