159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1052 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0712  protein of unknown function DUF255  57.74 
 
 		 657 aa  640    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0945  protein of unknown function DUF255  60.84 
 
 		 665 aa  711    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  57.61 
 
 		 665 aa  701    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1071  protein of unknown function DUF255  59.15 
 
 		 662 aa  698    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3900  hypothetical protein  57.5 
 
 		 673 aa  670    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8541  hypothetical protein  56.18 
 
 		 682 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  55.86 
 
 		 658 aa  641    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.788472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1052  hypothetical protein  100 
 
 		 652 aa  1303    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0830  hypothetical protein  57.27 
 
 		 669 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0098  protein of unknown function DUF255  55.65 
 
 		 677 aa  645    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  57.01 
 
 		 667 aa  706    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3705  protein of unknown function DUF255  59.71 
 
 		 703 aa  631  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164339  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0704  protein of unknown function DUF255  52.3 
 
 		 710 aa  618  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  52.98 
 
 		 699 aa  614  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  52.35 
 
 		 699 aa  606  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1641  protein of unknown function DUF255  50.97 
 
 		 696 aa  597  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3142  protein of unknown function DUF255  52.41 
 
 		 656 aa  589  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3431  protein of unknown function DUF255  55.59 
 
 		 682 aa  587  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455743 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11102  hypothetical protein  51.64 
 
 		 673 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000180128  normal  0.240263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4140  hypothetical protein  52.46 
 
 		 664 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4215  hypothetical protein  52.46 
 
 		 664 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4371  hypothetical protein  52.24 
 
 		 664 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1103  protein of unknown function DUF255  53.53 
 
 		 687 aa  575  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.491204  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4665  Fis family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 667 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2052  hypothetical protein  51.57 
 
 		 673 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299125  normal  0.344575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6036  hypothetical protein  53.77 
 
 		 596 aa  543  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  48.15 
 
 		 685 aa  533  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  46.12 
 
 		 696 aa  520  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  47.76 
 
 		 666 aa  519  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  45.77 
 
 		 700 aa  518  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  43.11 
 
 		 681 aa  511  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  40.35 
 
 		 690 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  38.74 
 
 		 686 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1171  hypothetical protein  46.78 
 
 		 756 aa  480  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.872428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  44.86 
 
 		 693 aa  476  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  38.22 
 
 		 686 aa  477  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  40.98 
 
 		 699 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  36.83 
 
 		 680 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2477  hypothetical protein  43.98 
 
 		 679 aa  459  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  38.03 
 
 		 711 aa  450  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  42.5 
 
 		 665 aa  446  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  42.58 
 
 		 681 aa  445  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  34.94 
 
 		 675 aa  444  1e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0099  hypothetical protein  41.04 
 
 		 676 aa  442  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0429958 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0107  hypothetical protein  41.48 
 
 		 682 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.926575  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  42.61 
 
 		 678 aa  439  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  36.87 
 
 		 673 aa  439  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  42.98 
 
 		 725 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  40 
 
 		 723 aa  434  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  42.88 
 
 		 669 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  41.89 
 
 		 677 aa  432  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  41.8 
 
 		 706 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  41.78 
 
 		 672 aa  427  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  41.06 
 
 		 673 aa  425  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  38.56 
 
 		 699 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2744  hypothetical protein  41.45 
 
 		 676 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  39 
 
 		 711 aa  422  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  37.46 
 
 		 669 aa  420  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  37.87 
 
 		 684 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  39.16 
 
 		 707 aa  422  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  36.89 
 
 		 671 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  35.27 
 
 		 681 aa  419  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  33.58 
 
 		 686 aa  419  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  34.64 
 
 		 691 aa  415  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  36.46 
 
 		 680 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1579  protein of unknown function DUF255  42.66 
 
 		 610 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0345  hypothetical protein  38.19 
 
 		 700 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.308049  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  32.28 
 
 		 703 aa  404  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  38.74 
 
 		 705 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  40.82 
 
 		 660 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  38.78 
 
 		 694 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  37.75 
 
 		 700 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  41.07 
 
 		 697 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2283  hypothetical protein  37.41 
 
 		 700 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1299  protein of unknown function DUF255  38.99 
 
 		 750 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120536 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  41.08 
 
 		 680 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  37.41 
 
 		 721 aa  399  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  31.51 
 
 		 687 aa  396  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  38.02 
 
 		 706 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  45.27 
 
 		 718 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2926  protein of unknown function DUF255  38.03 
 
 		 746 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  39.34 
 
 		 676 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3473  hypothetical protein  37.93 
 
 		 676 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2172  protein of unknown function DUF255  38.71 
 
 		 714 aa  382  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0500393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  35.86 
 
 		 712 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  45.28 
 
 		 718 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  34.77 
 
 		 670 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  38.14 
 
 		 733 aa  378  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1296  protein of unknown function DUF255  39.19 
 
 		 744 aa  376  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.212217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1067  hypothetical protein  38.79 
 
 		 687 aa  379  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  44.32 
 
 		 718 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  37.34 
 
 		 751 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2244  hypothetical protein  37.45 
 
 		 715 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1283  hypothetical protein  37.03 
 
 		 687 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  36.13 
 
 		 720 aa  370  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2759  protein of unknown function DUF255  36.42 
 
 		 756 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  38.03 
 
 		 717 aa  367  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  37.57 
 
 		 722 aa  366  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2409  hypothetical protein  41.51 
 
 		 743 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260211  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  32.74 
 
 		 681 aa  367  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>