38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0308 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0308  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  924    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00549191  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3203  protein of unknown function DUF690  35.15 
 
 		 459 aa  160  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.161915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0674  hypothetical protein  32.12 
 
 		 464 aa  90.5  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.340047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8522  protein of unknown function DUF690  29.17 
 
 		 510 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.013435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8088  hypothetical protein  29.81 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1440  hypothetical protein  37.28 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1208  protein of unknown function DUF690  32.5 
 
 		 481 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0609  protein of unknown function DUF690  27.36 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1444  hypothetical protein  28.69 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3150  protein of unknown function DUF690  33.33 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7885  protein of unknown function DUF690  26.28 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0519943  normal  0.0107564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0396  hypothetical protein  31.93 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.769323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0986  hypothetical protein  32.57 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4812  protein of unknown function DUF690  36.42 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0399688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0477  hypothetical protein  31.52 
 
 		 479 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4839  hypothetical protein  34.36 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000509999 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0074  hypothetical protein  30.48 
 
 		 491 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0065  hypothetical protein  30.48 
 
 		 491 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0055  hypothetical protein  30.48 
 
 		 491 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00921629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0690  hypothetical protein  32.94 
 
 		 487 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.335063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8476  protein of unknown function DUF690  28.4 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0073  hypothetical protein  30.6 
 
 		 495 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0449137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13487  hypothetical protein  27.52 
 
 		 482 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0376841  normal  0.0257137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3295  protein of unknown function DUF690  27.48 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061282  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2228  hypothetical protein  32.35 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359411  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3367  protein of unknown function DUF690  26.38 
 
 		 472 aa  57  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04350  Protein of unknown function (DUF690)  27.21 
 
 		 519 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4962  hypothetical protein  34.65 
 
 		 453 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5959  hypothetical protein  31.01 
 
 		 504 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5556  hypothetical protein  31.01 
 
 		 504 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1150  hypothetical protein  30.52 
 
 		 457 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1140  hypothetical protein  30.52 
 
 		 457 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5462  hypothetical protein  25.84 
 
 		 486 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1123  hypothetical protein  30.52 
 
 		 485 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10290  hypothetical protein  25.79 
 
 		 538 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.225236  normal  0.597294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6576  protein of unknown function DUF690  29.47 
 
 		 540 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373249  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13904  hypothetical protein  30 
 
 		 480 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.784362 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5778  hypothetical protein  26.38 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981226  normal  0.352766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>