37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5222 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5222  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 
147 aa  298  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178812  normal  0.128048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0325  hypothetical protein  63.01 
 
 
147 aa  185  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246806  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2610  hypothetical protein  48.89 
 
 
159 aa  130  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5171  hypothetical protein  47.14 
 
 
160 aa  123  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5260  hypothetical protein  47.14 
 
 
160 aa  123  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5552  hypothetical protein  47.14 
 
 
160 aa  123  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10089  hypothetical protein  47.14 
 
 
224 aa  120  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29102  normal  0.214951 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21390  hypothetical protein  43.17 
 
 
184 aa  114  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0670  hypothetical protein  45.39 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338735  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0838  hypothetical protein  40.85 
 
 
162 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2607  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.97 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29980  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.633203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0758  hypothetical protein  37.61 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1770  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.07 
 
 
148 aa  70.1  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3232  hypothetical protein  32.45 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.200936 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2275  Polyketide cyclase/dehydrase  37.09 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3939  Polyketide cyclase/dehydrase  36.11 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01460  hypothetical protein  30.5 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0146  hypothetical protein  36.89 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06190  hypothetical protein  36.21 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22480  hypothetical protein  38.89 
 
 
212 aa  63.9  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1562  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1592  hypothetical protein  32.52 
 
 
164 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1616  hypothetical protein  32.52 
 
 
164 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0283  hypothetical protein  35.25 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2557  hypothetical protein  29.85 
 
 
177 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2697  hypothetical protein  30.16 
 
 
168 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408575  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1594  N-6 Adenine-specific DNA methylase  31.58 
 
 
206 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23960  Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein  28.06 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.151523  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00890  Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein  31.79 
 
 
194 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3906  hypothetical protein  27.63 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2498  hypothetical protein  31.86 
 
 
159 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.515948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1820  Polyketide cyclase/dehydrase  26.35 
 
 
153 aa  47.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2215  hypothetical protein  30.83 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.581092  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2272  hypothetical protein  30.83 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2226  hypothetical protein  30.83 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3553  hypothetical protein  29.53 
 
 
147 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>