47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2909 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 243 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  38.5 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.5 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  41.71 
 
 		 196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  39.32 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  36.87 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  35.98 
 
 		 192 aa  95.1  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  39.1 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  50.5 
 
 		 216 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  35.52 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  38.3 
 
 		 192 aa  89  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  32.11 
 
 		 198 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 198 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 187 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 		 193 aa  85.9  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 		 182 aa  85.9  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.99 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  53.52 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  34.5 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  29.63 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  31.65 
 
 		 230 aa  72  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  48 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  33.85 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  29.38 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  51.47 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  32.49 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  30.22 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  44.78 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  31.36 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  31.33 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  33.82 
 
 		 171 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 107 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 108 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2260  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 183 aa  42.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1059  normal  0.463419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 224 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1905  putative transcriptional regulator  42.25 
 
 		 176 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592557  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>