238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3897 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3897  Glycosyltransferase 28 domain protein  100 
 
 
429 aa  855    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2103  glycosyltransferase family 28 protein  53.12 
 
 
427 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646286  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1381  glycosyltransferase, MGT family  43.16 
 
 
430 aa  260  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0109047  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2652  Glycosyltransferase 28 domain protein  40 
 
 
423 aa  256  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00514492  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2842  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 
422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142528  normal  0.0240997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2328  glycosyl transferase family protein  29.98 
 
 
433 aa  112  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0735299  hitchhiker  0.00124939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5223  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0184372  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2248  protein of unknown function DUF1205  46.31 
 
 
370 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3283  glycosyltransferase, MGT family  27.91 
 
 
424 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1105  glycosyltransferase, MGT family  25.8 
 
 
429 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2966  glycosyl transferase family protein  33.84 
 
 
408 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4109  putative glycosyltransferase  26.39 
 
 
456 aa  97.1  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3223  glycosyltransferase, MGT family  26.06 
 
 
446 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1905  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
407 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0466  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
414 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00234533  normal  0.19115 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3906  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  26.75 
 
 
449 aa  92.8  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1296  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
426 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.205066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0705  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
423 aa  92.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1269  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
426 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1286  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
426 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.540508  normal  0.192884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4034  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
436 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.468428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3114  Glycosyl transferase-like UDP- glucuronosyltransferase  29.48 
 
 
379 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.826951  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4929  glycosyltransferase, MGT family  24.88 
 
 
426 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71822  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4035  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
432 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996814  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3573  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
434 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3646  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
434 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4886  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  27.91 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3578  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4659  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  25.91 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.717417  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2129  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  29.63 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2175  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  29.63 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271893  normal  0.342617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2116  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  29.63 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0869037 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1565  glycosyl transferase family protein  21.6 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.906358  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_1174  predicted protein  26.48 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2111  glycosyl transferase family protein  23.65 
 
 
425 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000775281  normal  0.550046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2098  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  28.97 
 
 
433 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.228633  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3557  glycosyltransferase MGT family  33.33 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1445  glycosyltransferase, MGT family  23.9 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4779  glycosyl transferase family 28  25.06 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.514672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3877  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 
440 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123353 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0972  glycosyltransferase, MGT family  23.31 
 
 
417 aa  77  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2327  glycosyltransferase, MGT family  19.71 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3553  glycosyltransferase, MGT family  35.68 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000992125  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3181  glycosyltransferase, MGT family  20.66 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2182  glycosyltransferase, MGT family  21.13 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1446  glycosyltransferase, MGT family  29.02 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1886  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2325  glycosyltransferase, MGT family  22.45 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2592  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29850  glycosyltransferase, MGT family  23.34 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1849  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  27.32 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1935  glycosyl transferase family protein  20.74 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0505353  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1888  glycosyltransferase; macrolide glycosyltransferase  20.49 
 
 
402 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.213265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3970  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  23.04 
 
 
426 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00770108  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2168  glycosyl transferase family protein  19.9 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32980  glycosyltransferase, MGT family  32.53 
 
 
381 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2036  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1940  putative glycosyltransferase  24.88 
 
 
440 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1906  glycosyl transferase family protein  22.3 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1936  glycosyl transferase family protein  20.39 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.527298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2083  glycosyl transferase family protein  20.39 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2114  glycosyltransferase, MGT family  20.49 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0820  glycosyltransferase, MGT family  31.54 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.894116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1898  glycosyltransferase; macrolide glycosyltransferase  20.44 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000618321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1806  macrolide glycosyltransferase  25.99 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19110  rhamnosyltransferase chain B  27.27 
 
 
426 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0583172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1781  hypothetical protein  27.37 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03260  sterol 3-beta-glucosyltransferase, putative  22.66 
 
 
1220 aa  69.3  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3265  glycosyltransferase, MGT family  26.48 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.085728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2073  glycosyltransferase, MGT family  21.83 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2418  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2041  putative glycosyl transferase  28.87 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221622  normal  0.0364064 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2801  macrolide glycosyltransferase  20.67 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756004 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2499  UDP-glycosyltransferase family protein  24.38 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.892944  hitchhiker  0.0000540048 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2825  glycosyltransferase, putative  21.39 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00274597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3232  glycosyltransferase, MGT family  21.83 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.26433 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2846  macrolide glycosyltransferase  21.48 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0273308  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5063  UDP-glycosyltransferase, MGT  25.49 
 
 
412 aa  67  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2942  glycosyltransferase, MGT family  26.87 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115511 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2600  glycosyl transferase family protein  20.9 
 
 
398 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2502  glycosyl transferase family protein  19.08 
 
 
391 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000624738  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5029  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 
408 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.153009  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2210  UDP-glycosyltransferase family protein  24.38 
 
 
395 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24668  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5544  glycosyl transferase family 28  25.23 
 
 
416 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2100  UDP-glycosyltransferase family protein  24.38 
 
 
395 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6241  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  24.6 
 
 
443 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12972  glycosyl transferase  28.23 
 
 
428 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2804  macrolide glycosyltransferase  21.1 
 
 
397 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2711  glycosyltransferase, MGT family  29.94 
 
 
387 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271214  normal  0.0182222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3785  macrolide glycosyltransferase-like  29.93 
 
 
265 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2401  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  26.8 
 
 
390 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0273557 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01607  UDP-glucose,sterol transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06750)  24.5 
 
 
1139 aa  63.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.144836  normal  0.210264 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22760  glycosyltransferase, MGT family  28.43 
 
 
389 aa  63.5  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3984  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  26.54 
 
 
396 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.387501  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5358  glycosyl transferase family 28  25.7 
 
 
433 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.217134  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0478  glycosyltransferase family 28 protein  26.63 
 
 
433 aa  63.2  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5006  sterol 3-beta-glucosyltransferase  28.15 
 
 
407 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.794532 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1700  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 
411 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125304  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3843  Glycosyltransferase 28 domain protein  22.14 
 
 
434 aa  63.2  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1648  rhamnosyltransferase chain B  26.8 
 
 
426 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>