90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2210 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2100  UDP-glycosyltransferase family protein  100 
 
 
395 aa  813    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2499  UDP-glycosyltransferase family protein  99.49 
 
 
395 aa  810    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.892944  hitchhiker  0.0000540048 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2210  UDP-glycosyltransferase family protein  100 
 
 
395 aa  813    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24668  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01170  glycosyltransferase  45.96 
 
 
330 aa  270  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3114  hypothetical protein  34.32 
 
 
436 aa  242  7e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0053335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5223  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0184372  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3897  Glycosyltransferase 28 domain protein  24.38 
 
 
429 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0466  glycosyl transferase family protein  23.68 
 
 
414 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00234533  normal  0.19115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1446  glycosyltransferase, MGT family  22.56 
 
 
399 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1781  hypothetical protein  25.64 
 
 
380 aa  60.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4886  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  32.74 
 
 
411 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1905  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 
407 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5611  glycosyl transferase family protein  21.91 
 
 
396 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126524  hitchhiker  0.000566285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2966  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2103  glycosyltransferase family 28 protein  28.05 
 
 
427 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646286  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1296  glycosyl transferase family protein  23.56 
 
 
426 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.205066 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6239  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  30.13 
 
 
415 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  normal  0.903811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3469  glycosyltransferase, MGT family  21.85 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704679  normal  0.0156932 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5544  glycosyl transferase family 28  35.8 
 
 
416 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888029 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5063  UDP-glycosyltransferase, MGT  22.73 
 
 
412 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6241  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  27.39 
 
 
443 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3906  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  25.71 
 
 
449 aa  54.3  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4978  glycosyltransferase, MGT family  30.49 
 
 
389 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4043  protein of unknown function DUF1205  22.49 
 
 
407 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.392322  normal  0.322652 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1700  glycosyl transferase family protein  21.71 
 
 
411 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3248  glycosyltransferase, MGT family  21.39 
 
 
399 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1286  glycosyl transferase family protein  23.56 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.540508  normal  0.192884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1269  glycosyl transferase family protein  23.56 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4929  glycosyltransferase, MGT family  23.5 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71822  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1867  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 
419 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1849  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  25.27 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2652  Glycosyltransferase 28 domain protein  28.03 
 
 
423 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00514492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1765  glycosyl transferase family protein  21.45 
 
 
402 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6314  glycosyl transferase family protein  21.45 
 
 
402 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1457  glycosyl transferase family 28  36.49 
 
 
415 aa  50.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3970  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  24.75 
 
 
426 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00770108  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3843  Glycosyltransferase 28 domain protein  36.76 
 
 
434 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4922  glycosyl transferase family protein  34.72 
 
 
435 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4659  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  28.57 
 
 
443 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.717417  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1445  glycosyltransferase, MGT family  20.64 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2480  glycosyl transferase family 28  28.77 
 
 
416 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2894  sterol 3-beta-glucosyltransferase  22.61 
 
 
435 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0690  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  19.62 
 
 
419 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10600  glycosyl transferase, UDP-glucuronosyltransferase  33.78 
 
 
425 aa  47.8  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3114  Glycosyl transferase-like UDP- glucuronosyltransferase  25.17 
 
 
379 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.826951  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4507  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 
427 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116165  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5686  glycosyltransferase, MGT family  22.87 
 
 
397 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0705  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 
423 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0718  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  19.62 
 
 
419 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194717  normal  0.0259108 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2132  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
420 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.257831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4034  glycosyl transferase family protein  22.98 
 
 
436 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.468428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2090  glycosyl transferase family 28  37.1 
 
 
424 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685331  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2409  glycosyl transferase family 28  33.33 
 
 
420 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5358  glycosyl transferase family 28  22.85 
 
 
433 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.217134  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1292  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  24.51 
 
 
417 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.269809  normal  0.226233 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2111  glycosyl transferase family protein  23.17 
 
 
425 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000775281  normal  0.550046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2041  putative glycosyl transferase  28.89 
 
 
406 aa  46.6  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221622  normal  0.0364064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2408  glycosyltransferase family 28 protein  32.1 
 
 
447 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3452  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
414 aa  46.6  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0972  glycosyltransferase, MGT family  22.65 
 
 
417 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2842  glycosyl transferase family protein  22.5 
 
 
422 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142528  normal  0.0240997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19110  rhamnosyltransferase chain B  23.23 
 
 
426 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0583172 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2502  glycosyl transferase family protein  23.66 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000624738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1778  glycosyl transferase family protein  20.66 
 
 
402 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.72129 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10777  UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G11590)  38.78 
 
 
491 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.165826 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1105  glycosyltransferase, MGT family  23.48 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2116  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  25.44 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0869037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0907  sterol 3-beta-glucosyltransferase  32.79 
 
 
416 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.499452  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2175  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  25.44 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271893  normal  0.342617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2129  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  25.44 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390544  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2036  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3043  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  22.06 
 
 
419 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000372483 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5032  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
427 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4779  glycosyl transferase family 28  23.89 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.514672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2098  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  29.27 
 
 
433 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.228633  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2033  hypothetical protein  33.87 
 
 
378 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0492847  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3785  macrolide glycosyltransferase-like  27.96 
 
 
265 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5095  glycosyl transferase family protein  24.06 
 
 
427 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509328  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3135  glycosyltransferase, MGT family  24.19 
 
 
428 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215343 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3273  glycosyl transferase family protein  24.06 
 
 
427 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0719433  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0177  sterol 3-beta-glucosyltransferase  21.33 
 
 
427 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5567  hypothetical protein  31.58 
 
 
387 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661467  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2662  glycosyl transferase  36.23 
 
 
395 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5051  hypothetical protein  25.27 
 
 
451 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1648  rhamnosyltransferase chain B  22.25 
 
 
426 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2114  glycosyltransferase, MGT family  23.98 
 
 
403 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2083  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 
402 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1936  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 
402 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.527298  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0362  sterol 3-beta-glucosyltransferase  20.3 
 
 
417 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0442187  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2182  glycosyltransferase, MGT family  22.16 
 
 
402 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>