20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1539 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1539  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  801    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1258  hypothetical protein  44.36 
 
 		 650 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  44.17 
 
 		 739 aa  333  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  44.79 
 
 		 521 aa  262  6.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0796  hypothetical protein  35.51 
 
 		 535 aa  249  9e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1015  hypothetical protein  38.71 
 
 		 701 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693082  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2087  AAA ATPase  39.45 
 
 		 685 aa  229  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1348  hypothetical protein  35.34 
 
 		 643 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  32.74 
 
 		 746 aa  210  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  32.66 
 
 		 866 aa  203  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0023  hypothetical protein  35.06 
 
 		 576 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.640701  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2066  hypothetical protein  34.79 
 
 		 636 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1199  putative ATP-binding protein  35.05 
 
 		 545 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0498844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  34.35 
 
 		 880 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1122  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.41 
 
 		 572 aa  170  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4830  putative ATP-binding protein  31.37 
 
 		 525 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4450  putative ATP-binding protein  34.72 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4916  putative ATP-binding protein  33.9 
 
 		 377 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3378  hypothetical protein  38.6 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2546  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1027 aa  60.1  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000509076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>