19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1805 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2025  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  62.07 
 
 
764 aa  903    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1805  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  100 
 
 
738 aa  1466    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0438  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  29.79 
 
 
826 aa  115  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49512  predicted protein  23.72 
 
 
743 aa  102  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0545641 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0075  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  22.39 
 
 
712 aa  95.9  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.70229 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0640  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  25.22 
 
 
731 aa  92.4  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.252493  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01455  hypothetical protein similar to oligosaccharyl transferase (Eurofung)  21.15 
 
 
741 aa  85.9  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.531962 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1689  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  34.33 
 
 
781 aa  75.1  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.317922  normal  0.350479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0431  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  35 
 
 
781 aa  74.7  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1781  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  34.23 
 
 
777 aa  71.2  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0356227 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0997  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  31.21 
 
 
779 aa  68.6  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01850  conserved hypothetical protein  22.99 
 
 
815 aa  62  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82607  oligosaccharyl transferase subunit  33.33 
 
 
745 aa  59.3  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.214118  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_55197  oligosaccharyl transferase  37.29 
 
 
911 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.94 
 
 
2073 aa  49.7  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_55198  STT3 subunit-like protein  38.3 
 
 
894 aa  48.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.835655  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3149  hypothetical protein  25.52 
 
 
808 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1220  acetyltransferase  24.59 
 
 
713 aa  45.8  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.60212  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1164  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  35.87 
 
 
736 aa  43.9  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>