More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1455 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1455  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
653 aa  1289    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.183766  hitchhiker  0.0000524636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1988  ATPase central domain-containing protein  63.31 
 
 
664 aa  669    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204493  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  54.03 
 
 
855 aa  528  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1627  AAA ATPase central domain protein  45.99 
 
 
1110 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.856063  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  43.09 
 
 
839 aa  399  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1454  ATPase central domain-containing protein  72.83 
 
 
366 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000393055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4249  AAA ATPase, central region  41.51 
 
 
846 aa  366  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7100  ATPase central domain-containing protein  41.39 
 
 
780 aa  365  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1144  stage V sporulation protein K  41.43 
 
 
1930 aa  362  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3318  AAA ATPase central domain protein  42.02 
 
 
823 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.488425  normal  0.919341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2403  AAA ATPase central domain-containing protein  40.29 
 
 
779 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2144  ATPase  41.09 
 
 
802 aa  352  1e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844898  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1592  AAA ATPase central domain protein  42.62 
 
 
819 aa  343  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00365213  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0170  stage V sporulation protein K  36.78 
 
 
550 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.129019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1517  spoVK domain-containing protein  32.33 
 
 
1133 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.885165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6840  ATPase central domain-containing protein  52.79 
 
 
354 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153796  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4841  ATPase central domain-containing protein  33.72 
 
 
1105 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585558  hitchhiker  0.0091693 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4241  AAA ATPase, central region  44.92 
 
 
390 aa  241  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.434554  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2862  AAA ATPase central domain protein  48.6 
 
 
379 aa  240  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3526  AAA ATPase central domain protein  48.29 
 
 
341 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1396  AAA ATPase central domain protein  48.29 
 
 
341 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0226  AAA ATPase central domain protein  49.42 
 
 
344 aa  234  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0467  ATPase central domain-containing protein  47.17 
 
 
564 aa  233  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.12935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1283  AAA ATPase central domain protein  41.12 
 
 
389 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1312  AAA ATPase central domain protein  41.67 
 
 
389 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1867  ATPase central domain-containing protein  47.08 
 
 
344 aa  224  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0460326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2132  AAA ATPase central domain protein  44.53 
 
 
322 aa  221  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.474775  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4389  ATPase central domain-containing protein  45.04 
 
 
466 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17420  AAA+ family ATPase  44.87 
 
 
466 aa  217  4e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.131578  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1502  AAA ATPase central domain protein  45.78 
 
 
321 aa  216  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000852955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3309  AAA ATPase central domain protein  45.08 
 
 
617 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0029  AAA+ class-like ATPase  45.08 
 
 
469 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.509013  hitchhiker  0.00474583 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1880  ATPase central domain-containing protein  44.22 
 
 
318 aa  213  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00868854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1619  ATPase central domain-containing protein  42.23 
 
 
298 aa  211  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.684878  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  28.81 
 
 
2310 aa  207  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1118  AAA ATPase  42.81 
 
 
331 aa  207  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000607625  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2104  stage V sporulation protein K  41.79 
 
 
310 aa  204  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0331  AAA ATPase  40 
 
 
320 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000626535  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0684  AAA ATPase, central region  41.6 
 
 
320 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1224  stage V sporulation protein K  42.15 
 
 
310 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000254018  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3926  CbxX/CfqX monofunctional  41.18 
 
 
311 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3060  AAA ATPase central domain protein  43.97 
 
 
541 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283109 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1280  CbbX protein  40.55 
 
 
341 aa  196  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325141  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3584  AAA ATPase central domain protein  41.73 
 
 
678 aa  196  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.883196  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3809  stage V sporulation protein K  40.68 
 
 
318 aa  195  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1496  stage V sporulation protein K  40.68 
 
 
318 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0780968  normal  0.0751264 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2067  ATPases of the AAA+ class-like protein  38.2 
 
 
365 aa  195  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1566  AAA ATPase central domain protein  44.66 
 
 
329 aa  195  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.201221  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3030  CbbX protein  39.78 
 
 
310 aa  194  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00687874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11610  AAA ATPase central domain protein  44.26 
 
 
348 aa  193  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2939  ATPase central domain-containing protein  42.91 
 
 
309 aa  193  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.949786  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2725  AAA ATPase central domain protein  40.73 
 
 
321 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00914326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3475  sporulation stage V protein K  40.54 
 
 
318 aa  192  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0352307  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2784  AAA type ATPase  41.53 
 
 
298 aa  192  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3760  stage V sporulation protein K  40.54 
 
 
318 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3737  stage V sporulation protein K  39.93 
 
 
318 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3555  stage V sporulation protein K  39.93 
 
 
318 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3454  stage V sporulation protein K  39.93 
 
 
318 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3467  stage V sporulation protein K  39.93 
 
 
318 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3839  stage V sporulation protein K  39.93 
 
 
318 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3719  stage V sporulation protein K  39.93 
 
 
318 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0200700000000003e-24 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0773  ATPase central domain-containing protein  40.49 
 
 
574 aa  191  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0453  CbbX-like protein  43.03 
 
 
334 aa  190  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1329  AAA ATPase, central region  41.3 
 
 
306 aa  190  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1701  ATPase central domain-containing protein  41.16 
 
 
308 aa  190  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164899  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0329  ATPase central domain-containing protein  48.33 
 
 
616 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351983  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0983  hypothetical protein  43.75 
 
 
299 aa  189  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00278176  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2710  ATPase central domain-containing protein  41.7 
 
 
309 aa  187  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.947167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0072  ATPase central domain-containing protein  40.88 
 
 
574 aa  187  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927916  normal  0.0298572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0359  ATPase central domain-containing protein  45.09 
 
 
594 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0702866  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1916  CbxX/CfqX monofunctional  42.42 
 
 
317 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.931527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0370  AAA ATPase, central region  45.09 
 
 
594 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0380  ATPase central domain-containing protein  45.09 
 
 
594 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1749  CbbX protein  41.3 
 
 
308 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4051  AAA ATPase, central region  39.27 
 
 
304 aa  185  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3749  AAA ATPase, central region  39.27 
 
 
304 aa  185  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1480  AAA type ATPase  42.34 
 
 
318 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0411  ATPase central domain-containing protein  44.64 
 
 
615 aa  184  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.448945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13903  hypothetical protein  41.9 
 
 
573 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0394  AAA ATPase central domain protein  44.12 
 
 
558 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0521615  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0064  AAA ATPase, central region  38.05 
 
 
573 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2387  sporulation stage V protein K  40.29 
 
 
318 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0379773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0073  ATPase central domain-containing protein  38.05 
 
 
573 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183052  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0054  ATPase central domain-containing protein  39.93 
 
 
573 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0220398 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0763  ATPase  43.9 
 
 
301 aa  182  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10289  hypothetical protein  43.36 
 
 
631 aa  182  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000685477  normal  0.631153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6395  CbbX-like protein  39.59 
 
 
310 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12600  AAA+ family ATPase  44.36 
 
 
681 aa  181  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37602  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2451  CbbX-like protein, putative AAA ATPase  40.33 
 
 
349 aa  181  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.349953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2927  CbbX like protein  39.27 
 
 
304 aa  181  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3253  phosphoribulokinase/uridine kinase  40.98 
 
 
312 aa  180  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346779  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0826  ATPase central domain-containing protein  39.2 
 
 
306 aa  179  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08171  RuBisCo-expression protein CbbX  43.03 
 
 
305 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0673  AAA ATPase, central region  34.78 
 
 
487 aa  178  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.265099 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3720  AAA ATPase, central region  40.49 
 
 
307 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220422  hitchhiker  0.00179613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1071  ATPase central domain-containing protein  40.82 
 
 
596 aa  177  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1603  ATPase  39.29 
 
 
301 aa  177  6e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3962  AAA ATPase-like  40.49 
 
 
306 aa  177  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157351 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6495  CbbX protein  40.25 
 
 
329 aa  176  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5463  ATPase central domain-containing protein  40.54 
 
 
599 aa  174  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>