140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0982 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0982  protein of unknown function UPF0060  100 
 
 		 112 aa  216  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236233  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1507  hypothetical protein  63.21 
 
 		 111 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118428  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1757  hypothetical protein  55.14 
 
 		 109 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1733  hypothetical protein  55.14 
 
 		 109 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2216  hypothetical protein  57.84 
 
 		 103 aa  131  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.160487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4073  protein of unknown function UPF0060  63.11 
 
 		 122 aa  129  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1681  hypothetical protein  55.56 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3546  protein of unknown function UPF0060  59.26 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1184  hypothetical protein  60.38 
 
 		 110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.45839e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1798  hypothetical protein  56.88 
 
 		 110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2546  protein of unknown function UPF0060  53.15 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.465405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2204  hypothetical protein  56.48 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2533  protein of unknown function UPF0060  58.33 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000116156  normal  0.0524259 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2545  protein of unknown function UPF0060  60.67 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.462566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0815  hypothetical protein  55.05 
 
 		 111 aa  110  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1682  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2805  hypothetical protein  53.21 
 
 		 111 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0715  hypothetical protein  57.01 
 
 		 109 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4423  hypothetical protein  52.38 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0009  hypothetical protein  51.43 
 
 		 110 aa  103  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4957  hypothetical protein  51.38 
 
 		 111 aa  103  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0343479 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2364  hypothetical protein  46.67 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2408  hypothetical protein  46.67 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.130394  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3474  protein of unknown function UPF0060  52.78 
 
 		 111 aa  103  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.288197 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45111  predicted protein  47.22 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.977587  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5385  hypothetical protein  53.7 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2786  hypothetical protein  53.27 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19950  hypothetical protein  48.18 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0102643 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05280  hypothetical protein  50.93 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.53643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12657  hypothetical protein  51.85 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000162308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14640  hypothetical protein  49.54 
 
 		 111 aa  101  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.702088  normal  0.333944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3406  hypothetical protein  50.93 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.679363  normal  0.282544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3127  hypothetical protein  50.93 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0931  protein of unknown function UPF0060  53.27 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4238  hypothetical protein  48.6 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.12468  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2162  protein of unknown function UPF0060  50.46 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3114  hypothetical protein  49.54 
 
 		 111 aa  99.4  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3233  hypothetical protein  47.71 
 
 		 119 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7600  membrane protein  50.47 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0852  protein of unknown function UPF0060  46.67 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2845  hypothetical protein  46.3 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0666  hypothetical protein  46.73 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1139  hypothetical protein  43.93 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.798922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2087  hypothetical protein  45.79 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.752744 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1656  hypothetical protein  46.6 
 
 		 141 aa  88.6  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1668  protein of unknown function UPF0060  44.86 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0916  hypothetical protein  42.45 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.201272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2550  hypothetical protein  49.07 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.201615  normal  0.61856 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1341  hypothetical protein  42.06 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5052  hypothetical protein  42.86 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.597089 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1498  hypothetical protein  39.25 
 
 		 110 aa  87.4  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0278138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2513  hypothetical protein  49.07 
 
 		 113 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.811146  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2558  hypothetical protein  49.07 
 
 		 113 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2632  hypothetical protein  46.46 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4718  protein of unknown function UPF0060  49.46 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2955  hypothetical protein  41.12 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2554  hypothetical protein  39.62 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1326  hypothetical protein  42.31 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4776  protein of unknown function UPF0060  42.31 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0366686  hitchhiker  0.00123631 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0196  hypothetical protein  38.24 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1996  hypothetical protein  42.31 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0351  hypothetical protein  40.57 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0701  hypothetical protein  44 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4032  hypothetical protein  41.9 
 
 		 105 aa  76.6  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1018  protein of unknown function UPF0060  41.9 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.357312  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  41.67 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4944  hypothetical protein  43.14 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.300598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1473  hypothetical protein  42.16 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0232  hypothetical protein  37.74 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1975  hypothetical protein  37.74 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3084  hypothetical protein  36.79 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.662192  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3679  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2942  protein of unknown function UPF0060  37.74 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  hitchhiker  0.00264399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3077  protein of unknown function UPF0060  43.75 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0586655 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0342  hypothetical protein  40.74 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4363  protein of unknown function UPF0060  43.93 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313348  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4425  hypothetical protein  46.74 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00189805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0485  hypothetical protein  37.38 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1160  hypothetical protein  45 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0587  hypothetical protein  39.6 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1172  hypothetical protein  45 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0240568  normal  0.121257 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41111  predicted protein  39.81 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2715  hypothetical protein  37.74 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858893  normal  0.216037 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1254  hypothetical protein  46.24 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0263746  normal  0.108455 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2268  hypothetical protein  42.31 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108701  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05320  hypothetical protein  41 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0866851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0802  hypothetical protein  45.16 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1283  hypothetical protein  45.16 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000413611  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1931  hypothetical protein  40.57 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0387347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2511  hypothetical protein  37.25 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0462845  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4243  protein of unknown function UPF0060  42.57 
 
 		 110 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1835  hypothetical protein  38.89 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.132551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4131  protein of unknown function UPF0060  42.57 
 
 		 110 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.344067  normal  0.23278 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3331  hypothetical protein  35.58 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1615  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1674  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.975768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1668  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2061  protein of unknown function UPF0060  38.68 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151826  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2048  hypothetical protein  38.68 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.791171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1618  hypothetical protein  38.68 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>