147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1341 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1341  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  246  5e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0916  hypothetical protein  85.32 
 
 
110 aa  192  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.201272  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1498  hypothetical protein  82.57 
 
 
110 aa  191  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0278138  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1139  hypothetical protein  80 
 
 
110 aa  185  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.798922  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2955  hypothetical protein  81.82 
 
 
110 aa  184  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2554  hypothetical protein  74.07 
 
 
110 aa  165  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0351  hypothetical protein  71.96 
 
 
110 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4032  hypothetical protein  72.38 
 
 
105 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0587  hypothetical protein  66.06 
 
 
110 aa  158  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0485  hypothetical protein  71.43 
 
 
108 aa  157  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376985  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0232  hypothetical protein  68.18 
 
 
117 aa  157  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1975  hypothetical protein  68.52 
 
 
108 aa  157  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1326  hypothetical protein  70.48 
 
 
105 aa  155  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1668  protein of unknown function UPF0060  70.09 
 
 
110 aa  154  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2845  hypothetical protein  69.44 
 
 
111 aa  153  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2087  hypothetical protein  69.16 
 
 
110 aa  153  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.752744 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3679  hypothetical protein  64.76 
 
 
105 aa  148  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4776  protein of unknown function UPF0060  68.57 
 
 
106 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0366686  hitchhiker  0.00123631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1996  hypothetical protein  69.52 
 
 
106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1656  hypothetical protein  63.64 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2632  hypothetical protein  60.36 
 
 
112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5052  hypothetical protein  63.81 
 
 
106 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.597089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  65.42 
 
 
222 aa  140  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05320  hypothetical protein  60.91 
 
 
110 aa  133  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0866851  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1160  hypothetical protein  61.9 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1172  hypothetical protein  61.9 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0240568  normal  0.121257 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1473  hypothetical protein  59.62 
 
 
111 aa  130  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4944  hypothetical protein  62.75 
 
 
110 aa  130  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.300598 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1598  protein of unknown function UPF0060  67.33 
 
 
110 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0157763  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2289  hypothetical protein  65.35 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.616642  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2746  hypothetical protein  63.73 
 
 
106 aa  122  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.304303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4425  hypothetical protein  63.04 
 
 
110 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00189805  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1254  hypothetical protein  63.04 
 
 
110 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0263746  normal  0.108455 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01551  hypothetical protein  60.4 
 
 
108 aa  120  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520057  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2061  protein of unknown function UPF0060  60.4 
 
 
108 aa  120  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151826  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01541  hypothetical protein  60.4 
 
 
108 aa  120  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1655  hypothetical protein  60.4 
 
 
108 aa  120  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0427679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1789  hypothetical protein  60.4 
 
 
108 aa  120  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.477899  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2048  hypothetical protein  60.4 
 
 
108 aa  120  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.791171  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2291  hypothetical protein  60.4 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  hitchhiker  0.000000000030396 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1283  hypothetical protein  61.96 
 
 
132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000413611  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1618  hypothetical protein  59.41 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333014  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0802  hypothetical protein  61.96 
 
 
110 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1931  hypothetical protein  59.41 
 
 
108 aa  118  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0387347  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3077  protein of unknown function UPF0060  70.65 
 
 
109 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0586655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1615  hypothetical protein  63.37 
 
 
108 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1674  hypothetical protein  63.37 
 
 
108 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.975768  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1668  hypothetical protein  63.37 
 
 
108 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1606  hypothetical protein  63.37 
 
 
108 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1835  hypothetical protein  61.39 
 
 
108 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.132551  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2942  protein of unknown function UPF0060  49.06 
 
 
109 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  hitchhiker  0.00264399 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4243  protein of unknown function UPF0060  60 
 
 
110 aa  105  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3084  hypothetical protein  47.66 
 
 
107 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.662192  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2715  hypothetical protein  49.06 
 
 
109 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858893  normal  0.216037 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4131  protein of unknown function UPF0060  60 
 
 
110 aa  105  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.344067  normal  0.23278 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0701  hypothetical protein  54.08 
 
 
107 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2037  hypothetical protein  59.14 
 
 
155 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0196  hypothetical protein  47.12 
 
 
107 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2268  hypothetical protein  60.58 
 
 
111 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108701  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0342  hypothetical protein  57.55 
 
 
110 aa  98.2  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2216  hypothetical protein  49.5 
 
 
103 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.160487  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1837  hypothetical protein  48.54 
 
 
111 aa  94.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1018  protein of unknown function UPF0060  47.06 
 
 
106 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.357312  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01651  membrane protein YnfA  72.41 
 
 
84 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2511  hypothetical protein  46.08 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0462845  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1170  protein of unknown function UPF0060  46.08 
 
 
106 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.540258  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2230  hypothetical protein  45.28 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3233  hypothetical protein  45.45 
 
 
119 aa  90.1  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0436  hypothetical protein  55.32 
 
 
108 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4238  hypothetical protein  46.73 
 
 
112 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.12468  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1507  hypothetical protein  41.44 
 
 
111 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118428  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2837  protein of unknown function UPF0060  50 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.578312  normal  0.331063 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1789  hypothetical protein  54.26 
 
 
108 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4423  hypothetical protein  41.23 
 
 
117 aa  87.4  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0982  protein of unknown function UPF0060  42.06 
 
 
112 aa  87.4  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236233  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4073  protein of unknown function UPF0060  41.07 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2204  hypothetical protein  42.45 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1184  hypothetical protein  45.1 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.45839e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2004  hypothetical protein  45.97 
 
 
130 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0347623  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1757  hypothetical protein  47 
 
 
109 aa  84.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19950  hypothetical protein  42.73 
 
 
112 aa  84.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0102643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1733  hypothetical protein  47 
 
 
109 aa  84.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4363  protein of unknown function UPF0060  42 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313348  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2302  putative transmembrane protein  49.46 
 
 
99 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1798  hypothetical protein  42.73 
 
 
110 aa  84  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4105  hypothetical protein  44 
 
 
113 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4957  hypothetical protein  40.74 
 
 
111 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0343479 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1681  hypothetical protein  38.61 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2889  protein of unknown function UPF0060  43.52 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  hitchhiker  0.00858506 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1682  hypothetical protein  40.78 
 
 
109 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2370  hypothetical protein  47.66 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  0.777163 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0009  hypothetical protein  39.62 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3546  protein of unknown function UPF0060  38.68 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0815  hypothetical protein  39.05 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05280  hypothetical protein  44.95 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.53643  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14640  hypothetical protein  38.74 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.702088  normal  0.333944 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3331  hypothetical protein  42 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2546  protein of unknown function UPF0060  38.89 
 
 
118 aa  77  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.465405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4121  protein of unknown function UPF0060  51 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3114  hypothetical protein  38.74 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0138946 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>