144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4423 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008537  Arth_4423  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  226  7e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4238  hypothetical protein  86.49 
 
 		 112 aa  197  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.12468  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3233  hypothetical protein  85.19 
 
 		 119 aa  186  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05280  hypothetical protein  79.09 
 
 		 110 aa  177  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.53643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0009  hypothetical protein  79.09 
 
 		 110 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0815  hypothetical protein  79.82 
 
 		 111 aa  176  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12657  hypothetical protein  79.63 
 
 		 110 aa  176  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000162308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2805  hypothetical protein  78.9 
 
 		 111 aa  175  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0715  hypothetical protein  77.98 
 
 		 109 aa  174  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0666  hypothetical protein  74.31 
 
 		 111 aa  169  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4957  hypothetical protein  73.39 
 
 		 111 aa  167  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0343479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7600  membrane protein  74.55 
 
 		 110 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769625  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3474  protein of unknown function UPF0060  76.15 
 
 		 111 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.288197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2162  protein of unknown function UPF0060  71.68 
 
 		 113 aa  164  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800491  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14640  hypothetical protein  72.97 
 
 		 111 aa  163  8e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.702088  normal  0.333944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3127  hypothetical protein  71.96 
 
 		 108 aa  161  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3406  hypothetical protein  71.96 
 
 		 108 aa  159  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.679363  normal  0.282544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0931  protein of unknown function UPF0060  72.48 
 
 		 109 aa  159  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5385  hypothetical protein  71.56 
 
 		 110 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2786  hypothetical protein  70.54 
 
 		 113 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3114  hypothetical protein  66.67 
 
 		 111 aa  154  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2550  hypothetical protein  74.77 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.201615  normal  0.61856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2513  hypothetical protein  71.68 
 
 		 113 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.811146  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2558  hypothetical protein  71.68 
 
 		 113 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4718  protein of unknown function UPF0060  74.55 
 
 		 110 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2204  hypothetical protein  66.97 
 
 		 110 aa  151  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19950  hypothetical protein  66.06 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0102643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0852  protein of unknown function UPF0060  60.19 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2216  hypothetical protein  58.65 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.160487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0982  protein of unknown function UPF0060  52.38 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236233  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1184  hypothetical protein  49.54 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.45839e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4073  protein of unknown function UPF0060  51.79 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1507  hypothetical protein  45.05 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118428  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45111  predicted protein  49.09 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.977587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1798  hypothetical protein  49.09 
 
 		 110 aa  97.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2364  hypothetical protein  47.12 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2408  hypothetical protein  47.12 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.130394  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1681  hypothetical protein  48.08 
 
 		 121 aa  95.1  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3546  protein of unknown function UPF0060  47.62 
 
 		 108 aa  93.6  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1682  hypothetical protein  44.95 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0701  hypothetical protein  43.81 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1139  hypothetical protein  43.93 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.798922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1733  hypothetical protein  46.36 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1757  hypothetical protein  46.36 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2942  protein of unknown function UPF0060  42.06 
 
 		 109 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  hitchhiker  0.00264399 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3084  hypothetical protein  40.57 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.662192  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2845  hypothetical protein  45.54 
 
 		 111 aa  90.5  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1018  protein of unknown function UPF0060  39.05 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.357312  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2546  protein of unknown function UPF0060  44.14 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.465405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2715  hypothetical protein  42.99 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858893  normal  0.216037 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2087  hypothetical protein  47.37 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.752744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1668  protein of unknown function UPF0060  47.37 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1341  hypothetical protein  41.23 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0916  hypothetical protein  41.82 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.201272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1498  hypothetical protein  42.73 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0278138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2955  hypothetical protein  45.87 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41111  predicted protein  44.76 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1170  protein of unknown function UPF0060  38.1 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.540258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1473  hypothetical protein  41.07 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1975  hypothetical protein  44.04 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2632  hypothetical protein  42.2 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0196  hypothetical protein  37.86 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2545  protein of unknown function UPF0060  52.27 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.462566 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1656  hypothetical protein  42.31 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4032  hypothetical protein  41.9 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0232  hypothetical protein  43.12 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2837  protein of unknown function UPF0060  43.52 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.578312  normal  0.331063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4363  protein of unknown function UPF0060  44.76 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313348  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2554  hypothetical protein  39.25 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05320  hypothetical protein  40.35 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0866851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2004  hypothetical protein  45 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0347623  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1160  hypothetical protein  42.11 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2533  protein of unknown function UPF0060  46.73 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000116156  normal  0.0524259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  40.19 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1172  hypothetical protein  42.11 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0240568  normal  0.121257 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0485  hypothetical protein  40.37 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1996  hypothetical protein  42.86 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2302  putative transmembrane protein  42.27 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3679  hypothetical protein  39.05 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2370  hypothetical protein  40.57 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  0.777163 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1837  hypothetical protein  39.09 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5052  hypothetical protein  39.05 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.597089 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3331  hypothetical protein  38.46 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0587  hypothetical protein  39.22 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1326  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4944  hypothetical protein  38.74 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.300598 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2511  hypothetical protein  35.29 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0462845  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4425  hypothetical protein  45.74 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00189805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4776  protein of unknown function UPF0060  40.95 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0366686  hitchhiker  0.00123631 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0351  hypothetical protein  40.57 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4243  protein of unknown function UPF0060  41.44 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4131  protein of unknown function UPF0060  41.44 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.344067  normal  0.23278 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3077  protein of unknown function UPF0060  42.71 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0586655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6500  protein of unknown function UPF0060  45.28 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813001  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1283  hypothetical protein  43.62 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000413611  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0802  hypothetical protein  43.62 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4105  hypothetical protein  35.4 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1380  hypothetical protein  45.54 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.114709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2230  hypothetical protein  39.05 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1254  hypothetical protein  42.55 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0263746  normal  0.108455 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>