136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2545 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2545  protein of unknown function UPF0060  100 
 
 
108 aa  204  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.462566 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3546  protein of unknown function UPF0060  79.63 
 
 
108 aa  174  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2533  protein of unknown function UPF0060  83.33 
 
 
108 aa  156  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000116156  normal  0.0524259 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1184  hypothetical protein  65.42 
 
 
110 aa  153  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.45839e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2546  protein of unknown function UPF0060  70.37 
 
 
118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.465405 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2364  hypothetical protein  58.42 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2408  hypothetical protein  58.42 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.130394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1507  hypothetical protein  61.68 
 
 
111 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118428  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0982  protein of unknown function UPF0060  60.19 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236233  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1681  hypothetical protein  60.95 
 
 
121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1733  hypothetical protein  55.14 
 
 
109 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1757  hypothetical protein  55.14 
 
 
109 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1798  hypothetical protein  56.88 
 
 
110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1682  hypothetical protein  55.45 
 
 
109 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2216  hypothetical protein  54.9 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.160487  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4073  protein of unknown function UPF0060  54.81 
 
 
122 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45111  predicted protein  49.07 
 
 
126 aa  102  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.977587  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2805  hypothetical protein  48.15 
 
 
111 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05280  hypothetical protein  49.07 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.53643  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0815  hypothetical protein  48.6 
 
 
111 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0009  hypothetical protein  50.47 
 
 
110 aa  99  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4423  hypothetical protein  50.47 
 
 
117 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2204  hypothetical protein  44.44 
 
 
110 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12657  hypothetical protein  45.37 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000162308  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0715  hypothetical protein  49.53 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3474  protein of unknown function UPF0060  49.06 
 
 
111 aa  94.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.288197 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14640  hypothetical protein  46.73 
 
 
111 aa  94.7  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.702088  normal  0.333944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5385  hypothetical protein  47.66 
 
 
110 aa  94  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0852  protein of unknown function UPF0060  46.67 
 
 
107 aa  94  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3127  hypothetical protein  44.44 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247319  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4238  hypothetical protein  47.22 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.12468  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0931  protein of unknown function UPF0060  50 
 
 
109 aa  92  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0666  hypothetical protein  47.22 
 
 
111 aa  91.3  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4957  hypothetical protein  44.86 
 
 
111 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0343479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3114  hypothetical protein  45.79 
 
 
111 aa  90.9  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19950  hypothetical protein  46.73 
 
 
112 aa  91.3  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0102643 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2786  hypothetical protein  45.79 
 
 
113 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3233  hypothetical protein  46.73 
 
 
119 aa  89.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3406  hypothetical protein  45.37 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.679363  normal  0.282544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7600  membrane protein  46.73 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769625  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2162  protein of unknown function UPF0060  42.59 
 
 
113 aa  86.7  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800491  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3084  hypothetical protein  45.28 
 
 
107 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.662192  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2845  hypothetical protein  42.45 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2955  hypothetical protein  42.99 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2550  hypothetical protein  46.3 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.201615  normal  0.61856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2513  hypothetical protein  46.3 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.811146  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2558  hypothetical protein  46.3 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0916  hypothetical protein  42.99 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.201272  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0701  hypothetical protein  44.23 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1139  hypothetical protein  42.45 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.798922  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2554  hypothetical protein  40.57 
 
 
110 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2087  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.752744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1668  protein of unknown function UPF0060  40 
 
 
110 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1498  hypothetical protein  43.93 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0278138  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4718  protein of unknown function UPF0060  45.37 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2942  protein of unknown function UPF0060  41.12 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  hitchhiker  0.00264399 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1341  hypothetical protein  39.25 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4363  protein of unknown function UPF0060  45.28 
 
 
110 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313348  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3331  hypothetical protein  44 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2715  hypothetical protein  41.12 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858893  normal  0.216037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  40.74 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2511  hypothetical protein  41.58 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0462845  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1931  hypothetical protein  39.81 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0387347  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1170  protein of unknown function UPF0060  43.14 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.540258  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01551  hypothetical protein  39.81 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520057  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2061  protein of unknown function UPF0060  39.81 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151826  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0196  hypothetical protein  35.29 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2746  hypothetical protein  40.4 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.304303  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1655  hypothetical protein  39.81 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0427679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1789  hypothetical protein  39.81 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.477899  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2048  hypothetical protein  39.81 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.791171  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01541  hypothetical protein  39.81 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0351  hypothetical protein  37.74 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0485  hypothetical protein  39.45 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376985  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4032  hypothetical protein  40.19 
 
 
105 aa  72  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1618  hypothetical protein  39.81 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333014  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1996  hypothetical protein  36.79 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4105  hypothetical protein  42 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2302  putative transmembrane protein  43.01 
 
 
99 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2291  hypothetical protein  38.83 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  hitchhiker  0.000000000030396 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5052  hypothetical protein  34.91 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.597089 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1975  hypothetical protein  37.38 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4776  protein of unknown function UPF0060  35.85 
 
 
106 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0366686  hitchhiker  0.00123631 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0232  hypothetical protein  37.38 
 
 
117 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1326  hypothetical protein  38.68 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3679  hypothetical protein  38.32 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1018  protein of unknown function UPF0060  40.2 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.357312  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2230  hypothetical protein  39.62 
 
 
106 aa  67  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2632  hypothetical protein  39.25 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1656  hypothetical protein  39.22 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1606  hypothetical protein  38.83 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0587  hypothetical protein  35.29 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1615  hypothetical protein  38.83 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1674  hypothetical protein  38.83 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.975768  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1668  hypothetical protein  38.83 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2289  hypothetical protein  36.89 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.616642  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1837  hypothetical protein  39.22 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4944  hypothetical protein  38.89 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.300598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21660  hypothetical protein  38 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41111  predicted protein  36.45 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330048  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>