22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7823 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_7823  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  100 
 
 
271 aa  537  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7222  hypothetical protein  43.64 
 
 
514 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0191551  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06082  hypothetical protein  36.52 
 
 
361 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00845  hypothetical protein  36.52 
 
 
361 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210026  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1997  hypothetical protein  37.38 
 
 
493 aa  132  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1718  hypothetical protein  37.14 
 
 
466 aa  132  6e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255426  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11900  hypothetical protein  39.32 
 
 
579 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.55763  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1093  hypothetical protein  39.81 
 
 
579 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0516  hypothetical protein  33.05 
 
 
454 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4983  hypothetical protein  37.67 
 
 
575 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291511  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0634  MORN motif-containing protein  37.21 
 
 
575 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0733  MORN repeat family protein  36.74 
 
 
575 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0236191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3811  MORN repeat-containing protein  37.56 
 
 
577 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0603  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  35.94 
 
 
577 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0551  MORN domain-containing protein  38.46 
 
 
642 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0596  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  37.95 
 
 
577 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0772523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0590  MORN repeat-containing protein  37.44 
 
 
603 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1518  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  33.77 
 
 
500 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00370729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0943  hypothetical protein  35.16 
 
 
519 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707363  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2722  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  33.48 
 
 
500 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3361  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  38.82 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259599  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0488  Legumain  27.52 
 
 
726 aa  52.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479245  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>