22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0015 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0015  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0010  hypothetical protein  65.45 
 
 
293 aa  295  8e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0016  hypothetical protein  41.94 
 
 
273 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.571689  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2933  hypothetical protein  38.37 
 
 
297 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0018  hypothetical protein  45.49 
 
 
278 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0017  hypothetical protein  40.68 
 
 
278 aa  139  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3949  hypothetical protein  44.59 
 
 
325 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.315669  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1765  hypothetical protein  41.15 
 
 
323 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3399  hypothetical protein  37.56 
 
 
347 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.274598  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0940  hypothetical protein  33.63 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0663  hypothetical protein  32.3 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3351  hypothetical protein  36.11 
 
 
349 aa  79  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6682  hypothetical protein  32.58 
 
 
567 aa  79  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3710  hypothetical protein  41.24 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1336  hypothetical protein  33.7 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251495  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0653  hypothetical protein  42.53 
 
 
188 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.344221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0679  hypothetical protein  39.77 
 
 
189 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0690  hypothetical protein  39.77 
 
 
189 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154988  normal  0.145005 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3865  hypothetical protein  29.03 
 
 
476 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1125  hypothetical protein  27.45 
 
 
283 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.730205  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6501  hypothetical protein  37.36 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3584  hypothetical protein  40.43 
 
 
166 aa  42.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>