24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2794 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2794  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
671 aa  1381    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3852  hypothetical protein  28.29 
 
 
457 aa  135  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.506454  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0082  hypothetical protein  30.96 
 
 
504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0179  conserved hypothetical lipoprotein  28.06 
 
 
448 aa  110  9.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0124  putative lipoprotein  28.1 
 
 
453 aa  96.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0084  putative lipoprotein  27.4 
 
 
453 aa  92  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5472  hypothetical protein  27.21 
 
 
464 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1193  hypothetical protein  24.39 
 
 
457 aa  79  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.01113  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2516  hypothetical protein  23.84 
 
 
509 aa  67  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219773 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1296  putative lipoprotein  24.54 
 
 
465 aa  60.1  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1831  tetratricopeptide TPR_4  25.45 
 
 
441 aa  57.4  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0598  putative lipoprotein  23.46 
 
 
483 aa  57.4  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0604  hypothetical protein  23.11 
 
 
559 aa  54.7  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243924  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1811  hypothetical protein  23.37 
 
 
407 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1890  hypothetical protein  23.39 
 
 
407 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5471  hypothetical protein  23.03 
 
 
457 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0735646 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2334  hypothetical protein  22.72 
 
 
461 aa  50.8  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000614425  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1668  hypothetical protein  23.53 
 
 
469 aa  48.5  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0825  TPR repeat-containing protein  21.7 
 
 
455 aa  47.8  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.692927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2066  hypothetical protein  21.96 
 
 
407 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  27.85 
 
 
412 aa  46.2  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  37.1 
 
 
268 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.87 
 
 
467 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0332171  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004002  putative lipoprotein  23.62 
 
 
465 aa  45.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>