23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2751 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2751  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0312385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2581  hypothetical protein  90.99 
 
 
233 aa  428  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1320  hypothetical protein  90.99 
 
 
233 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2053  hypothetical protein  89.24 
 
 
224 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113901  normal  0.0119007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2823  hypothetical protein  85.28 
 
 
232 aa  394  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2902  hypothetical protein  80.72 
 
 
225 aa  368  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0615892  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1252  hypothetical protein  80.18 
 
 
225 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2656  hypothetical protein  32.59 
 
 
196 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3213  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  98.2  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.052023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3212  hypothetical protein  31.22 
 
 
193 aa  86.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03903  hypothetical protein  52.05 
 
 
115 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0850  hypothetical protein  33.77 
 
 
164 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272158  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3211  hypothetical protein  65.22 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1147  hypothetical protein  37.5 
 
 
136 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2070  hypothetical protein  39.34 
 
 
127 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.981444 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1451  hypothetical protein  42.19 
 
 
136 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2334  hypothetical protein  30.3 
 
 
108 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.777792 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2943  hypothetical protein  33.85 
 
 
136 aa  49.3  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1524  hypothetical protein  42.19 
 
 
173 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.545795 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0240  hypothetical protein  51.28 
 
 
85 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2529  hypothetical protein  41.82 
 
 
70 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0798  hypothetical protein  44.26 
 
 
117 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.249703  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0838  hypothetical protein  38.57 
 
 
117 aa  42.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.011638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>