31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2748 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2748  HfaB protein  100 
 
 		 287 aa  581  1.0000000000000001e-165  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.941879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2651  HfaB protein  42.65 
 
 		 342 aa  188  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3727  HfaB protein  38.52 
 
 		 336 aa  175  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1082  HfaB protein  41.42 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.167536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6349  Putative protein involved in formation of curli polymers-like protein  37.04 
 
 		 467 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1066  curli production assembly/transport component CsgG  32.17 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1520  curli production assembly/transport component CsgG  25.97 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.301126  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1729  curli production assembly/transport component CsgG  26.64 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.214664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2051  curli production assembly/transport component CsgG  27.19 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.351157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1235  curli production assembly/transport component CsgG  27.19 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.947173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1250  curli production assembly/transport component CsgG  27.19 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.589697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1205  curli production assembly/transport component CsgG  27.19 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.749123  normal  0.584294 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2234  curli production assembly/transport component CsgG  27.19 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.734266 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2608  Curli production assembly/transport component CsgG  27.19 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0251589  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1416  curli production assembly/transport subunit CsgG  27.49 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0591449 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2096  curli production assembly/transport subunit CsgG  27.19 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2562  curli production assembly/transport component CsgG  27.19 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.25398 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01041  hypothetical protein  27.19 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.756314  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1156  curli production assembly/transport subunit CsgG  27.19 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1553  curli production assembly/transport component CsgG  27.88 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.301914  normal  0.209181 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01034  outer membrane lipoprotein  27.19 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.743614  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2588  curli production assembly/transport component CsgG  23.22 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2474  curli production assembly/transport component CsgG  25.48 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.248627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1820  curli production assembly/transport component CsgG  25.25 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010127  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2299  curli production assembly/transport component CsgG  28.04 
 
 		 283 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01506  putative transport protein for curli synthesis  24.03 
 
 		 253 aa  49.3  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1993  curli production assembly/transport component CsgG  25.56 
 
 		 286 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00606032  normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2465  curli production assembly/transport component CsgG  27.57 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3472  curli production assembly/transport component CsgG  27.57 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0643  curli production assembly/transport component CsgG  24.37 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2857  curli production assembly/transport component CsgG, putative  27.27 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.680035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>