22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0195 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0195  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  772    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000146938  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1820  hypothetical protein  32.58 
 
 
430 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219836  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0063  hypothetical protein  32.64 
 
 
380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.775578  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0492  hypothetical protein  33.33 
 
 
379 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.65383  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1253  hypothetical protein  31.79 
 
 
415 aa  176  8e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0271  hypothetical protein  37.96 
 
 
483 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2930  hypothetical protein  31.78 
 
 
386 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000188138  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2039  hypothetical protein  33.85 
 
 
463 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217007  normal  0.109783 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1648  hypothetical protein  34.28 
 
 
455 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.544844  hitchhiker  0.00111677 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0757  hypothetical protein  33.22 
 
 
459 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.503985  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0320  hypothetical protein  28.74 
 
 
459 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.758746  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1026  hypothetical protein  29.55 
 
 
422 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441563  normal  0.903414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2383  hypothetical protein  30.25 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00285086  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0061  hypothetical protein  26.76 
 
 
386 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2653  tetratricopeptide TPR_2  33.78 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0080  hypothetical protein  25.75 
 
 
415 aa  57  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1655  S-layer-like domain-containing protein  28.21 
 
 
431 aa  53.1  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19387  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0586  hypothetical protein  23.14 
 
 
286 aa  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000473168  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0760  S-layer-like domain-containing protein  24.54 
 
 
427 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0522  hypothetical protein  25.19 
 
 
505 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.263879  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  21.61 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1425  S-layer-like domain-containing protein  19.62 
 
 
414 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137658  normal  0.104765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>