34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0035 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0035  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  324  4.0000000000000003e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2086  hypothetical protein  57.14 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.58745 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1213  hypothetical protein  57.14 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0272669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2995  hypothetical protein  54.55 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0066  hypothetical protein  56.13 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.905175  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0657  hypothetical protein  56.77 
 
 		 160 aa  177  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0097  hypothetical protein  54.19 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.578349  hitchhiker  0.00635148 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1429  hypothetical protein  54.55 
 
 		 184 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1137  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  54.55 
 
 		 158 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.329696  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1794  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  54.55 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.109434  unclonable  0.00000000507783 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0412  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  53.9 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0738895  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1804  hypothetical protein  35.35 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.399716  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3740  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.23 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4880  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  25.89 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746169 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.61 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0289  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  24.66 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0864  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  24.32 
 
 		 147 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  31.15 
 
 		 157 aa  47.8  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2284  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.29 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145472  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.88 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  29.7 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.49 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  37.5 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  37.5 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0807  hypothetical protein  37.5 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0262203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  37.5 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0820  hypothetical protein  37.5 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.11136 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6269  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.59 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341844  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1820  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.08 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  27.83 
 
 		 176 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  31.65 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1407  nitroimidazole resistance protein, putative  45.95 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0471  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  23.58 
 
 		 142 aa  40.8  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0514663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.83 
 
 		 157 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00783233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>