35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5873 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008704  Mkms_5873  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  415  1e-115  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5473  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  415  1e-115  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2991  conserved hypothetical protein DUF1643  44.67 
 
 
172 aa  113  2e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4033  hypothetical protein  45.03 
 
 
173 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.773314  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3032  protein of unknown function DUF1643  39.87 
 
 
337 aa  110  1e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0234736  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2772  hypothetical protein  44.16 
 
 
170 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1928  hypothetical protein  42.86 
 
 
170 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00260784  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1110  hypothetical protein  44.16 
 
 
170 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135016  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2920  hypothetical protein  42.31 
 
 
169 aa  104  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.334962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2963  hypothetical protein  39.49 
 
 
155 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280917  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0083  hypothetical protein  41.67 
 
 
173 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3746  hypothetical protein  40.82 
 
 
172 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5791  hypothetical protein  35.29 
 
 
155 aa  94.7  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5660  protein of unknown function DUF1643  39.86 
 
 
158 aa  92.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.163406 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0639  hypothetical protein  41.18 
 
 
200 aa  87  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2474  protein of unknown function DUF1643  34.38 
 
 
186 aa  82.4  5e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06761  hypothetical protein  35.98 
 
 
215 aa  79.3  3e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4991  protein of unknown function DUF1643  34.64 
 
 
182 aa  76.6  2e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.369909 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0031  hypothetical protein  34.19 
 
 
162 aa  73.6  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00242203  normal  0.074145 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1722  hypothetical protein  36.65 
 
 
216 aa  72.8  3e-12  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1804  hypothetical protein  27.27 
 
 
173 aa  71.6  7e-12  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2367  hypothetical protein  34.46 
 
 
188 aa  70.1  2e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15551  hypothetical protein  25.15 
 
 
178 aa  69.3  3e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0244532  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4066  hypothetical protein  34.36 
 
 
198 aa  69.3  4e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04721  hypothetical protein  32.72 
 
 
189 aa  68.9  5e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0362408  normal  0.769212 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1210  hypothetical protein  37.25 
 
 
155 aa  66.6  3e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15701  hypothetical protein  23.35 
 
 
178 aa  66.6  3e-10  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.341972  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1464  hypothetical protein  23.31 
 
 
178 aa  64.3  1e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0120527  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15331  hypothetical protein  21.39 
 
 
177 aa  63.9  1e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2467  hypothetical protein  28.86 
 
 
167 aa  58.9  6e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.206216  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0045  hypothetical protein  28.19 
 
 
168 aa  57  2e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0045  hypothetical protein  28.19 
 
 
168 aa  57  2e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2504  hypothetical protein  28.19 
 
 
168 aa  57  2e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0922  hypothetical protein  28.28 
 
 
196 aa  55.5  6e-07  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5897  protein of unknown function DUF1643  32.73 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>