20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4916 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4830  putative ATP-binding protein  100 
 
 
525 aa  736    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4450  putative ATP-binding protein  89.62 
 
 
427 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4916  putative ATP-binding protein  100 
 
 
377 aa  759    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325325  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1199  putative ATP-binding protein  44.54 
 
 
545 aa  267  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0498844  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  44.29 
 
 
880 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  39.27 
 
 
521 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1258  hypothetical protein  36.36 
 
 
650 aa  178  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1348  hypothetical protein  39.13 
 
 
643 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0023  hypothetical protein  31.81 
 
 
576 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.640701  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0796  hypothetical protein  32.77 
 
 
535 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2066  hypothetical protein  35.06 
 
 
636 aa  160  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1122  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.82 
 
 
572 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  33.64 
 
 
739 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1539  hypothetical protein  33.9 
 
 
399 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  29.14 
 
 
866 aa  145  9e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1015  hypothetical protein  33.71 
 
 
701 aa  143  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693082  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2087  AAA ATPase  32.82 
 
 
685 aa  133  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  31.76 
 
 
746 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3378  hypothetical protein  34.95 
 
 
317 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2546  hypothetical protein  27.42 
 
 
1027 aa  43.5  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000509076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>